Metadata = []
Sequence = []
N=0
with open(file_location) as f: #opens file
content = f.read() #defines file under content
for char in content:
if char == ">":
while char != "\n":
実際に何もしない特別なキーを辞書に割り当てる方法はありますか？そのような私が実行したときにことを今ここに mydict = {}
key, value = 'foo', 'bar'
mydict[key] = value % now my dict has {'foo': 'bar'}
私はキーのいくつかの「特別な」値をしたい： は、私のような何かをしたい mydict[key] = va
インデックスエラーが見つかった場合、文字列を変数に渡すにはどうすればよいですか？コード検討： for l1, l2 in zip(open('file1.list'), open ('file2.list')):
a=fasta1[int(l1)]
b=fasta2[int(l2)]
alignments = pairwise2.align.globalxx(a,b
.fastaファイルをBiopythonで読み、DNA、RNAまたはタンパク質を扱っているかどうかを見積もっています。 はこれまでのところ、私はこのようなデータを読む： with open('file.fasta', 'r') as f:
for seq in sio.parse(f, 'fasta'):
# do stuff, depending on alphabet
私はfasta DNA配列を逆にすることを試みています。 fastafile=open('sequence (3).fasta','r')
entries=[]
reverse=""
sequence=['A','T','G','C','N']
for line in fastafile:
if not line.startswith('>'):
line = lin