openmpi

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私はVM VirtualBoxに新しいubuntu-16.04.2-desktop-amd64マシンを作成しましたが、RmpiでR環境を使用したいと考えています。以下の両方の方法で同様のエラーが発生します。 Ubuntuがインストールされていたとき、私はターミナルを開き、次のコマンドを実行： ~$ sudo apt-get update ~$ sudo apt-get install open

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MPI_Gatherで文字列を収集するopenmpi c

各プロセスで文字列を生成し、すべてを収集したい。しかし、各プロセスで作成された文字列は、intとcharを付加することによって作成されます。私はまだすべてを正しく収集することができません。すべての部分文字列を1つずつ印刷することができますが、rcv_stringを印刷しようとすると、部分文字列が1つだけ、またはセグメント化エラーが発生することがあります。 memsetを使って文字列の最後にゼロを

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誰かがこのvalgrindの出力をopen mpiで説明できますか？

私はOpenMPIを使用するアプリケーションをWindowsとLinuxで起動しています。しかし、Windows用のバージョンは問題なく動作していますが、Linux上で実行するとメモリ割り当てエラーが発生します。この問題は、より多くの計算が必要な特定のアプリケーション引数で発生します。メモリリークを解消するために、Valgrindを使ってLinuxバージョンアプリをチェックし、outputを得ま

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MPIのすべてのランクをどのようにしてランク0にする値を送るのですか？

私はn個のプロセスを持っていると言う：彼らは計算を行う、その後、0。このをランク付けするために結果を送信するには、私が起こるしたいものである：それはからの結果を持ってまでランク0は、をお待ちしておりますランクのすべてをを追加します。どうすればよいですか？また、私は次のことを避けたい：例えば、 4つのプロセスP0、P1、P2、P3、一方P1内 P1 -> P0 P2 -> P0 P3 -

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Pythonの端末呼び出しは、私は端末からコマンドを実行すると</p> <p>のFedora 20にOpenMPIのライブラリを利用してプログラムを実行しています適切なライブラリ

をロードしません。私はそれがへのアクセス権を持っている必要がありますので、パスが同じに設定されている subprocess.call(args,shell=True) と同じエラー結果：私はPythonのコンソールを介して、それを実行すると、私はエラーを返します同じライブラリ。このエラーを回避するために知っておく必要がある内部Pythonの機能はありますか？それとも、プログラムライブラ

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同じ関数でMPI_Barrierを2回呼び出すのは大丈夫ですか？

CでOpenMPIを使用する。は私が main() { MPI_Init(); //// Important Program Region MPI_Barrier(MPI_COMM_WORLD); // do something here MPI_Barrier(MPI_COMM_WORLD); //// MPI_Finalize(); } を持っているだと言うこ

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doMPIエラー：アプリケーションで要求された2つのスロットを満たすのに十分なスロットがシステムにありません

私のローカルマシンでdoMPIパッケージを実行しようとしています。クラスタにジョブを提出する。私はMac OSX Yosemiteを使用しており、brewを使ってopen mpi 2.0.2をインストールしています。 mpirun -V mpirun (Open MPI) 2.0.2 Report bugs to http://www.open-mpi.org/community/help/ 私は

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ZeroMQとOpenMPIの比較

誰かがより良いものを提供できますか？私はZeroMQ（それほどではない）とOpenMPIでの経験があります。私は両方ともメッセージの受け渡しのためのフレームワークであることを知っています。この2つのフレームワークの主な違いは何ですか？

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doMPIを使用してログに書き込む

私はHPCでdoMPIを実行しており、ワーカーから出力をログに記録したいと思います。 doParallelを使用して、私はmakeCluster(outfile='myfile.log')を使用することができました。 doMPIでは、いずれのメソッドにもoutfile引数がないようです。私はsinkWorkerOutput()を使ってみました。これは機能しますが、ワーカーの1人だけのログが書き込ま

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Open MPIとOpenMPを使用した魅力的な並列処理

愚かな質問かもしれませんが、とにかく恥ずかしいほどの並列問題に取り組んでいます。私は、作業を並列に実行できる独立したタスク（通信なし）に分けることができます。 1には、以下を使用することができますシェル script.shで： prog.cで #!/bin/bash let MY_ID=${OMPI_COMM_WORLD_RANK} ./a.out $MY_ID 我々は、単純な独立したプ