netcdf4

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私は私のLinux（Ubuntuの15.10）上のいくつかのアナコンダ/ Pythonパッケージをアップデートしなければならなかった、そしてその結果として、私は今、私が前に見たことがない、次のエラーメッセージが出ます： OSError: /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libnetcdff.so.6: undefined symbol:nc_rename_grp を Pyth

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PythonでnetCDF4のチャンクサイズを設定するには？

netCDF4ライブラリのデフォルトチャンク設定を見ることができますが、チャンクサイズを変更する方法はわかりません。 from netCDF4 import Dataset volcgrp = Dataset('datasets/volcano.nc', 'r') data = volcgrp.variables['abso4'] print data.shape print data.

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「とValueError：チャンクサイズは寸法サイズを超えることはできませんが、」

をnetCDFのためにxarrayを書き込もうとしたときのnetCDFファイルにxarrayオブジェクトを書き込もうとしたとき、私は、次のエラーを得た： "ValueError: chunksize cannot exceed dimension size" をデータが私の記憶のためには大きすぎますチャンクされる必要があります。 import xarray as xr ds=xr.open_

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netCDFの既存の変数に新しいディメンションを追加するにはどうすればよいですか？

コードはこの答えは動作しますAdd a new dimensionしかし、私がしたいことはしません。さらに私の問題を説明するために、私は以下の定義を持っています時間（無制限）、緯度、経度、4次元のレベルと1つの可変ジオポテンシャルの高さ。私がしたいのは、既存の可変ジオポテンシャル高さにdimz_Zという次元を追加することです。 netCDFファイルがncdump float hgt(time,

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pythonを使ってnetCDFファイルの値を置き換えてください

follの-999.0の値をすべて置き換えたいと思います。 netCDFファイルを0.0で区切ります。ファイルはここにある： https://www.dropbox.com/s/ohh7tntzm2pj1uw/all_SSP3_BaU_NoCC.nc?dl=0 ここに私の機能です： def modify_nc_value(path_inp, name_var, val_to_modify, new

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ソースとしてこれを使用してR

における多次元のNetCDF を連結/作成します。しかし、私は本当にncファイルとして保存することに興味があります。今の課題は、各月に降水量データを追加することです dimx <- ncdim_def("Lon", "degreesE", as.double(-90:-87)) dimy <- ncdim_def("Lat", "degreesN", as.double(14:16)) dim

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R（ncdf4パッケージ）の.nc4ファイルを読み取るときにエラーが発生しました

NASAからダウンロードした.nc4 filesのデータセットを使用しようとしています。フォーマットNCDF4は、this sourceによって確認されます。データベースを取得するためにRのダウンロード.fileを使用し、次にファイルをテストするための単純なnc_open（ncdf4パッケージ）を使用しました。残念なことに、結果は「不明なファイル形式」エラーです。ここで私replicatio

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通常のグリッドに不規則なグリッドデータを再分割するpyresampleを理解する

不規則なグリッド（ランバート円錐）のデータを通常のグリッドに再分割する必要があります。 pyresampleは私の最善の策だと思う。実際には私のオリジナルのlat、lonは1Dではありません（basemap.interpまたはscipy.interpolate.griddataを使う必要があるようです）。私はthis SO's answerが役に立ちました。しかし、空の補間データが得られます。私

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ラスタスタックからNetCDFファイルへのエクスポートR

これまでラスタスタックから書き込まれたnetcdfファイルからラスタレイヤ名を抽出しようとしています。ラスタスタックをncdfにエクスポートするとうまく動作します。たとえば、 library(raster) library(ncdf4) library(RNetCDF) #Create some rasters (x3) r1<-raster(system.file("external/