imagej-macro

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上のプラグインから、私が知っている私は現在、「最大強度Z-投影」機能を呼び出す必要があるJAVAでのImageJのプラグインをやっているを、Z-の関数を呼び出す方法あなたが「Image/Stacks/Z Project ...」に行くとImageJに既にあります。ここドキュメント：http://imagej.net/Z-functions#Maximum_Intensity_Z-projecti

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バッチをエクスポートするためのマクロVIDEOS（.avi）

以下のコードの大部分はImageJテンプレートからのもので、最後の6行は特注品です。目的は、ビデオ内の特定のフレームのみを選択し、小さい方のビデオを.aviとして書き出すことです。これをバッチ処理したいと思います。しかし、コードの最後の部分（ビデオを保存する）は動作していないようです...任意のアイデア？ input = getDirectory("Input directory"); outp

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ImageJマクロで新しいフォルダを作成し、新しいフォルダに出力を保存する

ImageJメッセージボードで見つかった次のマクロを変更してチャンネルをバッチ分割し、 "OneChannel"という名前の新しいフォルダを作成し、新しいフォルダに出力を保存します。コードは期待通りに機能します。新しいフォルダを作成し、チャンネルを分割して新しい名前で保存します。唯一の問題は、新しいファイルを元のフォルダと同じフォルダに保存するため、後で新しく作成したフォルダに手動でドラッグする必

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ImageJ/FIJIを使用してグリッド内のすべての要素の画像をトリミングする方法

12個の画像があります。私はImageJ/FIJIで処理しています。次に、すべての画像に対して、2923779のサイズ（ポイントあたりの面積__ピクセル^ 2）のグリッド（Analyze - > Tools - > Gridを使用）を均一に作成しました。それは次のようになります。は、私は何をしたい、グリッドのすべての要素に応じて、上記画像のそれぞれをトリミングして、ファイルなど、すべての作物を

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分割されたタイムステップと分割されたチャンネル（マクロImageJ）を使用したLIFファイルのBio-Formats変換

ImageJでマクロにLIFファイル（Leica形式）を開こうとしています。 LIFファイルには、52または45のタイムステップの4つの「LIFシリーズ」が含まれています。各タイムステップには3つのチャネルが含まれています。 filepath = "/mydirectory/myfile.lif"; out = "/mydirectory/myTIFF/"; run("Bio-Formats

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ヒストグラムデータのImageJエクスポートリスト

ImageJにマクロを記録しようとしています。私は私がやりたいことに似ていますがこの投稿 http://imagej.1557.x6.nabble.com/Saving-histogram-list-to-Excel-file-td3682144.html を見つけたが、それはRGBチャンネルを指します。グレーレベルのヒストグラムをエクスポートするにはどうしたらいいですか？

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ImageJ：PythonスクリプトでselectionType（）を使用した場合のNameError

ImageJの初心者で、ImageJマクロエディタでPythonを使用して次のマクロを再作成しようとしました。問題がある s = selectionType(); if(s == -1) { exit("There was no selection."); } else if(s != 10) { exit("The selection wasn't a point se

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呼び出されたイメージがImageJマクロに存在しない場合のデフォルトピクチャの入力

54種類のイメージを呼び出して開くマクロを作成しました。これらの画像はすべて1つのフォルダに保存されます。最初のようなフォルダが数多くあり、マクロはどのフォルダの画像からもスタックを作成できるように見えます。 open(image 1) open(image 2) open(image 3) open(image 4) open(image 5) open(image 6) open(