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NumPyの構造化配列を使用してMPI4Pyでデータを送受信しようとしています。以下は、私の配列構造である:NumPyを使用してMPI4Pyで構造化配列データを送受信する
numpy.zeros(FILE_LINES, dtype='i4,54b')
と、次のように私は、データを交換するためのsendrecv方法を使用しています:
comm.Sendrecv(data_send, dest=partner_rank, sendtag=data_tag, \
recvbuf=data_receive, source=partner_rank, recvtag=data_tag, status=None)
をしかし、通信メソッドが呼び出されたとき、私は例外を取得:
Traceback (most recent call last):
File "bipy.py", line 91, in <module>
bitonic_sort()
File "bipy.py", line 72, in bitonic_sort
bitonic_merge(i, ixj, (i & k) == 0)
File "bipy.py", line 51, in bitonic_merge
recvbuf=data_receive, source=partner_rank, recvtag=data_tag, status=None)
File "Comm.pyx", line 166, in mpi4py.MPI.Comm.Sendrecv (src/mpi4py.MPI.c:58898)
File "message.pxi", line 318, in mpi4py.MPI.message_p2p_send (src/mpi4py.MPI.c:21422)
File "message.pxi", line 301, in mpi4py.MPI._p_msg_p2p.for_send (src/mpi4py.MPI.c:21285)
File "message.pxi", line 111, in mpi4py.MPI.message_simple (src/mpi4py.MPI.c:19256)
File "message.pxi", line 58, in mpi4py.MPI.message_basic (src/mpi4py.MPI.c:18509)
KeyError: 'T{=l:f0:(54)b:f1:}'
これは、1つのデータ型(すべてのバイトなど)の配列を使用する場合に機能します。 MPI4Pyはこれらの構造化された配列を送信できませんか、何か間違っていますか?
私はSendrecv()型の関数は、単一の型のNumpy配列しか送ることができないと思います。一般的なPythonオブジェクトを送ることができるsendrecv()(小文字)はいつでも使用できますが、シリアル化オーバーヘッドがあります。 –