matplotlibで数千点のデータとそのラベル（グループ）をプロットする

Question

データの形状は(500000, 3)であり、最初の2つの列はx座標とy座標を表し、3番目の列はデータポイント@（X、Y）が属するラベル値。例えば

： - data= [ [20,10, 12.3320], [22, 13, 230.221],.....[..] ]

Iは、以下の方法を試してみました。しかし、これはあまりにも時間がかかり、解釈が不十分です。

import matplotlib.pyplot as plt 

colors = 10*['r.','g.','b.','c.','k.','y.','m.'] 

for i in range(len(labels)): 
    plt.scatter(data[i][0], data[i][1], colors[labels[i]],marker='.') 

plt.show() 

良い解釈につながる上記のコードに適しているimshow()またはその他のような他の方法はありますか？あなたがピップまたはcondaでインストールすることができvispy 0.4.0と

作品：matlplotlibで

Answer 1

散布機能が遅い静かですが、私は多数の点をプロットするためにGPUを使用vispyを使用することをお勧めします：ここで

pip install vispy 

は（自分のコンピュータ上で2秒未満にプロット）のコードです：

import numpy as np 
from vispy import scene, visuals, app 
import matplotlib.pyplot as plt 

data = np.random.random((500000,3)) 

canvas = scene.SceneCanvas(keys='interactive', show=True) 
view = canvas.central_widget.add_view() 
# Create the scatter plot 
scatter = scene.visuals.Markers() 
scatter.set_data(data[:,:2], face_color=plt.cm.jet(data[:,2])) 
view.add(scatter) 
view.camera = scene.PanZoomCamera(aspect=1) 
view.camera.set_range() 
app.run() 

vispyのための素晴らしいドキュメントがあり、あなたはあなたのpをカスタマイズすることができますface_color、edge_color、サイズ、edge_width、記号のような引数を持つset_data機能がたくさん...

あなたのデータの視覚化と幸運;）