phyloseq

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私はphyloseqのチュートリアルを見直しましたが、特定の分類群のストレスレベルを決定し、種より）、例えば家族や他の分類。これはデフォルトのGlobalPatternsデータはを設定し使用して家族の分類群のみ GPtaxa <- tax_table(GP)[, "Family"] GPotu <- otu_table(GP) GPsd <- sample_data(GP) GPpt

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各行の最大カラム

私は初心者ですので、サンプルデータフレームを作成することはできません。そのためにお詫び申し上げます。しかし、私は細菌の地域分析を行っており、各列の種と各行の各サンプルを持つ表があります。各列は各種の識別子です。データフレーム内には、各サンプルの種が豊富にあります。私の目標は、各サンプル（行）の最も豊富な種（カラム）を特定することです。私は、最も豊富な種の列識別子を持つサンプル（行）を持つデータフレ

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phyloseqのplot_net機能でフォントのサイズを変更するには？

私はplot_netでテキストのサイズを変更したいのですが、どのオプションも私のために働いていません。誰もが、私はこの問題をどのように修正することができますを教えていただけますか？私は p <- plot_net(physeqP, maxdist = 0.4, point_label = "ID", color = "Cond", shape = "Timeperiod") p + geom_te

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Phyloseqによって生成されたスタックバー

私はこの「R」パッケージを「phyloseq」と呼んでバイオインフォマティクスデータを分析しています。 otumat = matrix(sample(1:100, 100, replace = TRUE), nrow = 10, ncol = 10) otumat rownames(otumat) <- paste0("OTU", 1:nrow(otumat)) colnames(otum