ggtree

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テーブルにツリーといくつかのノード情報が格納されている場合は、ヒントを削除してそれに応じてテーブルを変更したいと思います。したがって、列ノードに正しい新しい番号を持つ新しいテーブルが必要です。 library(ape) library(ggtree) #make tree set.seed(2016-12-31) newrtree<-rtree(12) newrtreepo<-di2mu

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mapplyを使ってgeom_point2に引数を渡す

私の目的は、lapplyまたはそれに類似したmapplyを使って関数geom_point2への引数としてのパスリストです。同様の状況で、私はのようにgeom_cladelabelするリスト（またはリスト）を渡す成功を収めて： mapply(function (x,y,z,w,v,u,t,s) geom_cladelabel(node=x, label=y, align=F, etc. # Whe

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ggtreeのgetSubtree関数です。そのような関数はありません。

ggtreeパッケージv1.8.2をインストールしました。getSubtree関数を使いたいと思っています。 getSubtreeでエラー（）：しかし、私は驚くべきエラー:)取得私はggtreeパッケージのメンバーとしてRstudioヘルプでのfuctionを見ていても機能「getSubtree」を見つけることができなかったとし、 https://bioconductor.org/packag

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ggtreeプロット領域が十分に大きくない

私は、ブートストラップ標識ノードとユーザ定義/有色チップラベルで循環系統樹をプロットしようとしています。ブートストラップの結果とラベルが正しく動作するようにしましたが、どういうわけか私のグラフィックデバイスにプロットを完全に描画できませんでした。円形の葉の中心から離れて放射されたラベルは、自分自身の一部が欠けていた。唯一の方法は、チップのラベルサイズを非常に小さく設定することでした。距離行列とブ