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私は、樹状の状態の間の類似性を比較するために樹状図を作成しています。しかし、私はプロット(click for example)を生成するときに状態名がクリッピングするのを防ぐ方法を理解できません。何か案は?hclust/dendrogramプロットでラベルがクリッピングしないようにする
コード:
var.towhee <- read.csv(file="states.csv", header=TRUE, fill=TRUE)
rownames(var.towhee) <-var.towhee$State # Set row names to state name
var.towhee <- var.towhee[,-1] # Remove state column
library(vegan)
library(permute)
library(lattice)
norm <- decostand(var.towhee, method="normalize") # Normalize data
dis <- vegdist(norm, method="euclidian") # Calculate distances
UPGMA <- hclust(dis, method="average") # Cluster using UPGMA method
UPGMA <- as.dendrogram(UPGMA) # Convert hclust objects into dendrogram objects
plot(UPGMA, horiz=TRUE, xlab="Song Distance")
参考のために、これは私のデータをフォーマットする方法です:私は状態ではなく数字であることを行名を設定した
Variable 1 Variable 2 Variable 3
State 1 123 123 123
State 2 123 123 123
State 3 123 123 123
注意。これはプロットがラベルをつかむ場所です。
だから、簡単なここ
が切り取られたラベルとデンドログラムの例です!これは完全に機能しました。ご協力いただきありがとうございます。 – colinjnk