ローディングを使用して主成分分析のスコアを作成したいと考えていますが、データセットのスコアを計算するときにprincomp関数が実際に行っていることを理解できません。おもちゃの例:PRINCOMPローディングからスコアを構築するR
cc <- matrix(1:24,ncol=4)
PCAcc <- princomp(cc,scores=T,cor=T)
PCAcc$loadings
Loadings:
Comp.1 Comp.2 Comp.3 Comp.4
[1,] 0.500 0.866
[2,] 0.500 -0.289 0.816
[3,] 0.500 -0.289 -0.408 -0.707
[4,] 0.500 -0.289 -0.408 0.707
PCAcc$scores
Comp.1 Comp.2 Comp.3 Comp.4
[1,] -2.92770 -6.661338e-16 -3.330669e-16 0
[2,] -1.75662 -4.440892e-16 -2.220446e-16 0
[3,] -0.58554 -1.110223e-16 -6.938894e-17 0
[4,] 0.58554 1.110223e-16 6.938894e-17 0
[5,] 1.75662 4.440892e-16 2.220446e-16 0
[6,] 2.92770 6.661338e-16 3.330669e-16 0
私の理解では、スコアが負荷と再スケーリング元のデータの線形結合であるということです。 「手」で試してみる:
rescaled <- t(t(cc)-apply(cc,2,mean))
rescaled%*%PCAcc$loadings
Comp.1 Comp.2 Comp.3 Comp.4
[1,] -5 -1.332268e-15 -4.440892e-16 0
[2,] -3 -6.661338e-16 -3.330669e-16 0
[3,] -1 -2.220446e-16 -1.110223e-16 0
[4,] 1 2.220446e-16 1.110223e-16 0
[5,] 3 6.661338e-16 3.330669e-16 0
[6,] 5 1.332268e-15 4.440892e-16 0
これらの列は、それぞれ1.707825,2および1.333333の係数でオフになっています。どうしてこれなの?玩具データ行列は各列で同じ分散を有するので、正規化はここでは必要ではない。どんな助けでも大歓迎です。
ありがとうございます!
を必要とするポイントすべて同じ行にあります。したがって、PC1はすべての分散をキャプチャし、他のPCは役に立たなくなります(おそらくノイズから計算されるガベージ)。また、PC1のスコアがゼロ以外であることを明示します。 – flodel