2012-03-19 36 views
2

私はbiotoolboxパッケージ(http://code.google.com/p/biotoolbox/)でperlスクリプトを実行しましたが、jarfileに関連するエラーメッセージを受け取りました。jarfileにアクセスできない

$./bar2wig.pl 

This program will convert bar files to a wig file 
Usage: 
bar2wig.pl [--options...] <filename> 

    Options: 
    --in <filename> or <directory> 
    --out <filename> 

$ ./bar2wig.pl --in /Users/biotoolbox/scripts/ --out example 

This program will convert bar files to a wig file 
checking input file(s).... 
converting to gr files... 
Unable to access jarfile /usr/local/USeq/Apps/Bar2Gr 
writing wig file... 
cleaning up temp files... done 

エラー:jarfileにアクセスできません。 このスクリプトはperlですが、java関連のエラーのようです。

これについてのコメントはありますか?

+0

順番にアプリケーションが仕事を得るためにJavaのJARファイルを使用している可能性可能性が非常に高い内に位置しています場所を定義する必要があるとしています。 http://code.google.com/p/biotoolbox/wiki/BioToolBoxSetUpで説明されている設定手順全体を実行しましたか? –

答えて

2

はい、明らかにjarファイルが見つかりませんでした。 jarのWikiエントリを読んでください。ただし、それはJavaファイルの移植可能なパッケージだと言うだけで十分です。

あなたはそのjarファイルをダウンロードし、それが設定ファイル biotoolbox.cfg

関連する問題