円グラフの先頭にRを付けることはできません

Question

私は円グラフを作成するためにカスタム関数を使用しています。条件によっては、1つの円グラフまたは2つの円グラフをプロットします。私は2つのパイに対応する入力ファイルに2行がある条件は素晴らしいですが、入力ファイルが単一のパイに対応する単一の行である場合、凡例のフォントサイズを調整してタイトルをトップに追加するのに問題がありますそのプロットのここに私の機能があります

pie_plot<-function(mean.IU,isoforms,gene.name,output.file,group,output.screen){ 
    n.isoform<-length(isoforms) 
    color.pie<-as.vector(t(sapply(seq(1,0.1,length.out=n.isoform/5),function(i)rainbow(5,s=i)))) 

    if (nrow(mean.IU)==2){ 
    pdf(output.file,width=15) 

    par(mar=c(0,0,0,0),oma=c(0,0,10,0),bg="seashell") 
    layout(matrix(1:3,nrow=1),widths=c(2,1,2)) 
    pie(mean.IU[1,],col=color.pie,labels=ifelse(round(mean.IU[1,],3)<0.005,NA,paste(round(mean.IU[1,],3)*100,"%",sep="")),cex=max(0.4,1.71-0.121*sqrt(n.isoform)),radius=0.8) 
    mtext(group[1],cex=2) 
    plot.new() 
    legend("center",legend=isoforms,title="Isoform",fill=color.pie,bty="n",cex=max(0.25,3.0-sqrt(n.isoform)*0.25),ncol=1) 
    pie(mean.IU[2,],col=color.pie,labels=ifelse(round(mean.IU[2,],3)<0.005,NA,paste(round(mean.IU[2,],3)*100,"%",sep="")),cex=max(0.4,1.71-0.121*sqrt(n.isoform)),radius=0.8) 
    mtext(group[2],cex=2) 
    mtext(paste("Pie charts for gene ",gene.name,sep=""),outer=TRUE,cex=2.5,line=5,font=2) 

    dev.off() 
    } 
    else{ 
    pdf(output.file,width=15) 

    par(mar=c(0,0,0,0),oma=c(0,0,5,0),bg="seashell") 
    layout(matrix(1:2,nrow=1),widths=c(7,3)) 
    pie(mean.IU[1,],col=color.pie,labels=ifelse(round(mean.IU[1,],3)<0.005,NA,paste(round(mean.IU[1,],3)*100,"%",sep="")),cex=max(0.4,1.71-0.121*sqrt(n.isoform)),radius=0.8) 
    mtext(group[1],cex=2) 
    plot.new() 
    legend("center",legend=isoforms,title="Isoform",fill=color.pie,bty="n",cex=max(0.1,3.0-sqrt(n.isoform)*0.20),ncol= 1) 
    mtext(paste("Pie chart for gene ",gene.name,sep=""),outer=TRUE,cex=2.5,line=5,font=2) 
    dev.off()  
    } 
} 

私はここで間違っていますか？

Answer 1

プロットマージンに問題があり、2番目の条件を変更したときにすべてがうまくいったことがわかりました。

par(mar=c(0,0,0,0),oma=c(0,0,5,0),bg="seashell")からpar(mar=c(0,0,0,0),oma=c(0,0,10,0),bg="seashell")に変更されました。