python pie chart traceback

Question

私はPythonで円グラフを作成しようとしていますが、このトレースバックを取得し続けています。ここで私はそれを

python /evolinc_docker/lincRNA_fig.py All.lincRNAs.fa lincRNAs.with.CAGE.support.annotated.fa lincRNAs.overlapping.known.lincs.fa 

を実行していますどのようにこれは私のコード

#!/usr/bin/python 

import sys 
import re 
import matplotlib.pyplot as plt 

file1 = open(sys.argv[1]) 
file2 = open(sys.argv[2]) 
file3 = open(sys.argv[3]) 

all = [] 

count_1 = 0 
count_2 = 0 
count_3 = 0 

for line in file1: 
    line = line.strip() 
    if line.startswith(">"): 
     count_1 += 1 

all.append(count_1) 

for line in file2: 
     line = line.strip() 
     if line.startswith(">"): 
       if re.search("CAGE_PLUS", line): 
      count_2 += 1 

all.append(count_2) 

for line in file3: 
     line = line.strip() 
     if line.startswith(">"): 
     if re.search("known", line): 
        count_3 += 1 


all.append(count_3) 


labels = ["All lincRNA", "CAGE lincRNA", "Known lincRNA"] 
sizes = all 
colors = ['yellowgreen', 'mediumpurple', 'lightskyblue'] 

plt.pie(sizes,    # data 
     labels=labels,  # slice labels 
     colors=colors,  # array of colours 
     autopct='%1.1f%%' # print the values inside the wedges 
     ) 
plt.axis('equal') 

plt.savefig('lincRNA_piechart') 

であると私は取得していトレースバックは、私が簡略化され、すべてのリストを使用してプログラムを実行した

Traceback (most recent call last): 
    File "/evolinc_docker/lincRNA_fig.py", line 50, in <module> 
    plt.pie(sizes, labels=labels, colors=colors) 
    File "/usr/lib/pymodules/python2.7/matplotlib/pyplot.py", line 2959, in pie 
    ax = gca() 
    File "/usr/lib/pymodules/python2.7/matplotlib/pyplot.py", line 803, in gca 
    ax = gcf().gca(**kwargs) 
    File "/usr/lib/pymodules/python2.7/matplotlib/pyplot.py", line 450, in gcf 
    return figure() 
    File "/usr/lib/pymodules/python2.7/matplotlib/pyplot.py", line 423, in figure 
    **kwargs) 
    File "/usr/lib/pymodules/python2.7/matplotlib/backends/backend_tkagg.py", line 79, in new_figure_manager 
    return new_figure_manager_given_figure(num, figure) 
    File "/usr/lib/pymodules/python2.7/matplotlib/backends/backend_tkagg.py", line 87, in new_figure_manager_given_figure 
    window = Tk.Tk() 
    File "/usr/lib/python2.7/lib-tk/Tkinter.py", line 1767, in __init__ 
    self.tk = _tkinter.create(screenName, baseName, className, interactive, wantobjects, useTk, sync, use) 
_tkinter.TclError: no display name and no $DISPLAY environment variable 

Answer 1

です。

import matplotlib.pyplot as plt 
labels = ["All lincRNA", "CAGE lincRNA", "Known lincRNA"] 
sizes = [10, 20, 30] # my arbitrary list just for testing 
colors = ['yellowgreen', 'mediumpurple', 'lightskyblue'] 
plt.pie(sizes, labels=labels,colors=colors, autopct='%1.1f%%') 
plt.axis('equal') 
plt.show() 

そして私は次のプロットを得ることができました。だから私はあなたのpythonプログラムがいいと思う。しかし、DISPLAY env変数をチェックしたところ、

$ echo $DISPLAY 
/private/tmp/com.apple.launchd.VoooVvQSYh/org.macosforge.xquartz:0 

おそらく、あなたのDISPLAYをチェックして正しく設定することをお勧めします。