PythonのR(Bioconductor)でHMMを実装する方法に関する良い文献やチュートリアルを知っていますか? (特に配列解析用)隠しマルコフモデルのRまたはPythonでの実装
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A
答えて
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CRANにはHMMパッケージがありますが、これは始めるのに適しています。
http://cran.at.r-project.org/web/packages/HMM/index.html
これは、簡単にR自体から発見された:Python用
RSiteSearch("HMM")
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GHMMはtutorialを持っていますが、それは短いですし、彼らは
"Currently, the GHMM is utterly lacking in documentation.は" 私はthe Rabiner paperが好きなことを認めます。
私はthe use of HMM for genetic mappingに関する技術レポートを持っています。
Rabinerを少し読んで、何かを実装することをお勧めします。前方/後方方程式はほんの数行である。
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