階層型クラスタリングのためのELKI GUIクラスタリングの結果がありません

Question

私はELKIを初めて使いました。すでにWekaでテストしてクラスタ化したデータセットの基本的なクラスタリングを行う必要があります。私は、「GUIバージョン」を使用していると私は、「マウス」のデータを分析チュートリアルを読んELKIサイト上を設定します。私はEMと私のデータセットをクラスタ化し、成功したチュートリアルから（結果を可視化して出力

http://elki.dbs.ifi.lmu.de/wiki/Tutorial#Analyzingthemousedataset IパラメーターresultHandler：ResultWriter）を変更しました。私がフォルダに持っている結果は、cluster.txt、cluster-evaluation.txt、およびsettings.txtです。

階層アルゴリズム（SLINK、CLINKなど）の出力結果に問題があります。私が得た出力はsettings.txtだけですが、cluster.txtが必要です。

ログビューにエラーがないため、他のパラメータを変更する必要がありますか？階層的クラスタリング結果からパーティションを取得するには

Answer 1

、あなたはまた、クラスタ抽出方法を指定する必要があります。私たちは今、 -algorithmのパラメータを持っている、と順序が重要である

-algorithm clustering.hierarchical.extraction.HDBSCANHierarchyExtraction 
-algorithm CLINK 
-hdbscan.minclsize 50 

注意を。抽出アルゴリズムには、実際の階層的クラスタリングを行うための「ネスト」アルゴリズム呼び出しがあります。長期的には

、我々は（GUIの特に）オペレータベースのアプローチに移動したいです。コマンドラインでは、階層型クラスタリングを実行せずに抽出することはできないため、入れ子になった呼び出しはより安全です。

CLINKの場合、クラスタの品質はあまり良くありません（はです）。データをシャッフルして複数回実行すると結果が異なります。また、AGNESやAnderbergに完全なリンケージを試してもらいたい。 AGNESは常にO（n^3）であり、Anderbergは通常O（n^2）であり（最悪の場合はO（n^3））、どちらもより良い結果を生み出す距離はCLINKとは異なります）：