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私はColorMap
という名前のdfを持っていますが、同じフィーチャに対応するすべての数値を平均することを検討しています。ここにdfがあります。Rデータフレームで重複値を平均化する
> ColorMap
KEGGnumber Colors
1 c("C00489" 0.162
2 "C06104" 0.162
3 "C02656") 0.162
4 C00163 -0.173
5 c("C02656" -0.140
6 "C00036" -0.140
7 "C00232" -0.140
8 "C01571" -0.140
9 "C00422") -0.140
10 c("C00402" 0.147
11 "C06664" 0.147
12 "C06687" 0.147
13 "C02059") 0.147
14 c("C00246" 0.069
15 "C00902") 0.069
**16 C00033 0.011
...
25 C00033 -0.073**
26 C00048 0.259
**27 c("C00803" 0.063
...
37 C00803 -0.200
38 C00803 -0.170**
39 c("C00164" -0.020
40 "C01712" -0.020
...
165 c("C00246" 0.076
166 "C00902") 0.076
**167 C00163 -0.063
...
169 C00163 0.046**
170 c("C00058" -0.208
171 "C00036") -0.208
172 C00121 -0.178
173 C00033 -0.193
174 C00163 -0.085
私は最終的には彼らはお互いの隣にある必要はありません。この
> ColorMap
KEGGnumber Colors
1 C00489 0.162
2 C06104 0.162
3 C02656 0.162
4 C00163 -0.173
5 C02656 -0.140
6 C00036 -0.140
7 C00232 -0.140
8 C01571 -0.140
9 C00422 -0.140
10 C00402 0.147
11 C06664 0.147
12 C06687 0.147
13 C02059 0.147
14 C00246 0.069
15 C00902 0.069
**16 C00033 0.031**
26 C00048 0.259
**27 C00803 -0.100**
39 C00164 -0.020
40 C01712 -0.020
...
165 C00246 0.076
166 C00902 0.076
**167 C00163 0.0085**
170 C00058 -0.208
171 C00036 -0.208
172 C00121 -0.178
173 C00033 -0.193
174 C00163 -0.085
ようになりたいと思い、私は単純に簡単に可視化のためのそれらを選びました。私はすべてColors
の平均を1つのKEGGvalue
にしたいと思います。したがって、各KEGGvalue
は一意であり、重複はありません。
を持って
dplyr
を使用してグループ化します。読んだときに正しく解析されなかったように見えます。 –はい、私は知っていますが、それは簡単にbashの正規表現を介して修正することができ、私はそれに心配していません。しかし、あなたがrの解を持っているなら、それを聞いてみたいと思います。 –
最初の列を掃除することができれば、残りの部分は[このr-faqの]欺瞞です。(http://stackoverflow.com/q/11562656/903061) – Gregor