libpng16.so.16： `[email protected]_1.2.3.4 'への未定義の参照

Question

私は大学クラスター上に異なるソフトウェアの異なるバージョンの異なるビルドを持つ、フォークのフォーク（3D-caffe）をビルドしています/software/software/<package>/<version-compiler>/

cmakeのは、このコンパイル・ステップ実行する：

g++ -fPIC -Wall -Wno-sign-compare -Wno-uninitialized -O3 -DNDEBUG \ 
CMakeFiles/caffe.bin.dir/caffe.cpp.o -o caffe -rdynamic ../lib/libcaffe.so \ 
../lib/libproto.a /software/software/Boost/1.61.0-foss-2016a/lib/libboost_system.so \ 
/software/software/Boost/1.61.0-foss-2016a/lib/libboost_thread.so \ 
-lpthread -lglog /software/software/gflags/2.1.2-foss-2016a/lib/libgflags.so \ 
-lprotobuf -lpthread -lglog \ 
/software/software/gflags/2.1.2-foss-2016a/lib/libgflags.so \ 
-lprotobuf -lhdf5_hl -lhdf5 -lrt -lsz -lz -ldl -lm -lpthread -llmdb -lleveldb -lsnappy \ 
-lcudart -lcurand -lcublas -lcudnn \ 
/software/software/OpenCV/3.1.0-foss-2016a/lib/libopencv_highgui.so.3.1.0 \ 
/software/software/OpenCV/3.1.0-foss-2016a/lib/libopencv_imgcodecs.so.3.1.0 \ 
/software/software/OpenCV/3.1.0-foss-2016a/lib/libopencv_imgproc.so.3.1.0 \ 
/software/software/OpenCV/3.1.0-foss-2016a/lib/libopencv_core.so.3.1.0 \ 
-lopenblas -Wl,-rpath,/home/p253591/3D-Caffe/build/lib:/software/software/Boost/1.61.0-foss-2016a/lib:/software/software/gflags/2.1.2-foss-2016a/lib 

TL; DR：必需品の形態である（libzにリンクするため-lzに注意）：

g++ ... .../caffe.cpp.o -o caffe .../libcaffe.so .../libproto.a .../libboost_system.so ...more .so's and -lxyz's... -lz 

を210の

このエラー：

/software/software/libpng/1.6.23-foss-2016a/lib/libpng16.so.16: undefined reference to `inflateReset2@ZLIB_1.2.3.4' 
collect2: error: ld returned 1 exit status 

そして、私はg++に-print-file-name=libz.so.1オプションを指定すると、それがバージョンについて少し古すぎている、/lib/../lib64/libz.so.1を出力するので、これは、正しいと思われます。

私は/software/software/zlib/1.2.8-foss-2016a/lib/で新しいバージョンを持っていますが、I：

• 先頭に追加LD_LIBARY_PATHにこのパス、
• -rpathオプションに追加し、または
• が-Lオプションを使用して、それを追加し、

g++は、そのまま/lib/../lib64/libz.so.1を使用して報告しています-print-file-name

どうすればうまくいくのですか？-lzオプションを削除し、/software/software/zlib/1.2.8-foss-2016a/lib/libz.so.1を明示的にファイルとして追加してコンパイル/リンク時に含めることです。しかし、それはハックのように思えます。

-lzオプションを実行する場合、ではなく/software/software/zlib/1.2.8-foss-2016a/lib/libz.so.1の代わりにg++を使用するように指定できますか？好ましくは間接的にcmakeを介して（caffeを構築する場合）。

ありがとうございます！

EDIT

ldd状態右.soが使用される：私は「

# nm /software/software/zlib/1.2.8/lib/libz.so.1 
... 
0000000000008270 T inflateReset2 
... 
0000000000000000 A ZLIB_1.2.3.4 
.... 
# 

：

# ldd /software/software/libpng/1.6.23-foss-2016a/lib/libpng16.so.16 
     linux-vdso.so.1 => (0x00007fff55599000) 
     libz.so.1 => /software/software/zlib/1.2.8/lib/libz.so.1 (0x00007f7875b29000) 
     libm.so.6 => /lib64/libm.so.6 (0x00007f7875888000) 
     libpthread.so.0 => /lib64/libpthread.so.0 (0x00007f787566b000) 
     libc.so.6 => /lib64/libc.so.6 (0x00007f78752d7000) 
     /lib64/ld-linux-x86-64.so.2 (0x0000003328800000) 

また、シンボルこのlibz.so.1であるはずmは@と表示されています - undefined symbolの中に-errorが何らかの形でAタイプのシンボルを必要としていますバージョンチェックなどがある（しかし、私はld.so manページでは、この上の任意のドキュメントを見つけることができませんでした）

Answer 1

私の推測では、あなたが-Lだけそれに従う-lに影響を与える動作しませんどの-lz後-Lを追加することです。また、-rpathとLD_LIBRARY_PATHは、実行時ライブラリの検索（およびlddの出力）に影響を与え、コンパイルにあまり影響しないことにも注意してください。