グラフを（インタラクティブ）3DでPythonで可視化するにはどうすればよいですか？

Question

私はこの1つのようなPythonでグラフを持っている：

# Each element is a tuple with coordinates (x,y,z). 
# The index is the id of the vertex 
vertexList = [(0,0,0),(1,0,0),(1,1,0),(0,1,0), 
       (0,0,1),(1,0,1),(1,1,1),(0,1,1)] 

# Each element is a tuple with the vertex-ids and a weight (vertexId1, vertexId2, weight) 
edgeList = [(0,1,1), (1,2,1), (2,3,1), (3,0,1), 
       (0,4,1), 
       (4,5,1), (5,6,1), (6,7,1), (7,4,1)] 
graph = (vertexList, edgeList) 

これは小さな一例です。私が書いたアプリケーションは約100の頂点と300の辺を持つグラフを使います。

これはPythonで、好ましくはUbuntuで利用可能なライブラリを使ってこれを視覚化したいと思います。 3D視覚化でグラフを動かすことができれば素晴らしいことでしょう。私はUBIGRAPHを使用現時点では、これまで

何をやったか

。可視化との相互作用が非常に良いですが、私は頂点の座標を指定することはできません。

def visulizeGraph(Graph): 
    vertexList, edgeList = Graph 
    server_url = 'http://127.0.0.1:20738/RPC2' 
    server = xmlrpclib.Server(server_url) 
    G = server.ubigraph; 

    G.clear() 
    for identifier, vertex in enumerate(vertexList): 
     G.new_vertex_w_id(identifier) 
    for vertex1, vertex2, weight in edgeList: 
     x1, y1, z1 = vertexList[vertex1] 
     x2, y2, z2 = vertexList[vertex2] 

     G.new_edge(vertex1, vertex2) 

matplot

私はmatplotlibを見つけましたが、その非常に大きなました。私は好きなことをする例は見つけられませんでしたが、私はそれを見逃したかもしれません。 Ubuntuで利用可能です。

matplotと同じ問題がVTK。あなたが私にいくつかの実例を与えることができれば、それは最善の解決策かもしれません。

Answer 1

matplotlibを見ると、mplot3dが見えましたか？これはあなたが必要とするものかもしれません。

MPlot3D

、私は申し訳ありませんされていない場合、私はおそらくそれよりも多くのを助けることはできません。

Answer 2

私はまだこれを使用していませんが（例のスクリプトを実行する以上）、mayavi2は有望です。それはenthought pythonディストリビューションにバンドルされています。

また、あなたの質問には少し話題がありますが、networkxは、あなたがPythonでグラフを使って作業しているなら、かなりいいです。

これは少し役に立ちます。