私はSweave文書の作成を合理化しようとしています。私は人々の現在の設定について聞きたいと思います。シングルキーバインドが はSweave文書をコンパイルし、実行するには、他の半分に Sweave文書を開発するための推奨事項
とPDFを交換
「プロジェクトごとに1つのディレクトリ」設定とシンプルなMakefileを使用することを話した他のRユーザーはほとんどいません。あなたが疑うように、それはEmacs/ESSでうまくいきます。
私は、 'R CMD Sweave'を追加する前に書いたシンプルなシェルスクリプトsweaveを呼び出す傾向があります（Makefileが魅力的でない、YMMVを再作成またはコピーしているため）。私はまた、Emacsと自動リフレッシュpdfビューア（okularまたはkpdfのような）を使用します。 Emacs23はpdfファイルを直接プレビューすることもできますが、私はまだワークフローをそれに切り替える必要があります。
[email protected]:~$ cat bin/sweave
#!/bin/bash -e
function errorexit() {
echo "Error: $1"
exit 1
}
function filetest() {
if [ ! -f $1 ]; then
errorexit "File $1 not found"
fi
return 0
}
if [ "$#" -lt 1 ]; then
errorexit "Need to specify argument file"
fi
BASENAME=$(basename $1 .Rnw)
RNWFILE=$BASENAME.Rnw
filetest $RNWFILE
echo "library(tools); Sweave(\"$RNWFILE\")" \
| R --no-save --no-restore --slave
LATEXFILE=$BASENAME.tex
filetest $LATEXFILE && pdflatex $LATEXFILE
Eclipse用のStatETプラグインでは、そこに示唆していることはすべて実行できます。それが私がSweave開発に使うものです。ラテックスとRの両方を非常によく理解しています。
ここには、http://www.walware.de/goto/statetがあります。
Longhow Lamは素敵なガイド：http://www.splusbook.com/Rintro/R_Eclipse_StatET.pdfを書いています。私も "1-あたりのプロジェクトディレクトリ" とMakefileのアプローチを使用し
。また、HTMLで出力を作成するためのコマンドが含まれています。このコマンドは、tthを使用してOOoおよびMS Wordに変換できます。私の協力者の多くはMS Officeユーザーであり、PDF出力の使用に抵抗しているので、これは重要です。ヴァンダービルトのフランク・ハレルのツイキからこれをどうやって行うのか、多くのことを学びました。
個人的に、私は選択の私のエディタとしてgvimを使用し、を実行しているが、それはEmacsのからそのままそこからは、非常に簡単であることを確認してください。
OS XでTeXShopを使用して、LaTeXとSweaveのすべてのレポートを作成しています。
#!/usr/bin/env Rscript
args <- commandArgs(T)
fname <- strsplit(args[1],'\\.')[[1]][2]
Sweave(paste(fname,'Rnw',sep='.'))
system(paste('pdflatex',paste(fname,'tex',sep='.')))
はSweaveは現在、TeXShopの内部文書をコンパイルする選択方法であって、私にとっては、新しいコンパイルパイプラインには、次のものが含まれてい~/Library/TeXShop/Engines/にSweave.engineと呼ばれるファイルを、追加するのと同じくらい簡単です。私は、ファイルの先頭に次のTeXのハッシュ強打を追加することにより、文書のデフォルトに設定することができます。
% !TEX TS-program = Sweave
植字しますCMD-Tを押すPDFは自動的に別々にポップアップ表示document-窓。 TeXShopにもSyncTeX技術が組み込まれているため、RnwソースのCmd-ClickはPDFウィンドウの対応する出力を強調表示し、PDFウィンドウのCmd-ClickはRnwソースの対応する入力を強調表示します。
TeXShopはmac-onlyですが、Linux、Windows、Macでは素晴らしいQt/popplerベースのクローンTeXworksが利用でき、TeX hash-bangsやSyncTeXなどの多くの機能をサポートしています。 TeXworksはWindows用のMikTeXパッケージのバージョン2.8に含まれています。
私はRscriptを直接使うのが好きです！非常に多くのソリューションがRを呼び出すためにシェルを呼び出す...記録のために、ファイル拡張子を扱うための 'strsplit'と' paste'は必要ありません。 'Sweave'と' pdflatex'の両方が自動的に拡張子を追加します。 –
私は、TeX Shopが全ファイル名File.Rnwをエンジンに渡したので、その投稿を書いた時点で必要だったと思います。 'Sweave'はそれでうまくいくだろうが、' pdflatex'はチョークするだろう。 – Sharpie
--Rnwと.pdfファイルの間でcmd-clickをクリックしたとします。あなたもこれらのフープをジャンプする必要がありました：http://cameron.bracken.bz/synctex-with-sweavepgfsweave-in-texshoptexworks –
私にいくつかの時間を節約したことの1つは、emacsの「自動挿入」モードです。私はそれを設定して、新しい.rnwファイルを開くたびに、emacsが自動的に基本文書テンプレートを設定し、私が行う必要があるのは私のレポートを書くことだけです。
更新：私は自動挿入から離れました。今私は "template.el"アプローチを使用します。
お試しRStudio
私はEmacsとTeXShopのファンで、以前の回答で述べたとおりです。
しかし、Rstudioが私を倒し始めています。 Rのための急速に改良された専用IDEです。確かにチェックアウトする価値があります。
私はまだMac用のstandard R IDEで特定のR専用開発作業を行うのが大好きです。しかし、Sweaveのドキュメントと関連するR develを同時に使用すると、RStudioが勝利します。事実上ゼロ調整で動作します。元の質問の後半にあるPDF関連の機能についてはわかりません。
私は同意します。 Sweave、StatET、Eclipseはうまく機能します。私はEclipseでSweaveを設定する方法を記述した投稿を書いたhttp://bit.ly/adfhZ1 –
（スプラッシュブックのリンクは壊れていますが、私はそれを見つけて、次のように見えます。 .splusbook.com/RIntro/R_Eclipse_StatET.pdf） – isomorphismes