IResource（IProject）のプロパティをIResource.setPersistenceProeprtyに設定しています。この場合、プロパティ値は.metadataフォルダに保存されます。それはプロパティが.projectファイルから切断されているのであまり良くありません。Eclipseプロジェクトのプロパティ
プロジェクトプロパティを.projectファイルに保存するにはどうすればよいですか？
一般的な解決策は、プロジェクトの内側に配置されたファイルにを格納しているproject scoped preferencesを（使用することですin <プロジェクト> /.settingsフォルダ）。
ProjectScope ps = new ProjectScope(projectResource);
IEclipsePreferences prefs = ps.getNode("my.plugin.id");
prefs.put("key", "value");
prefs.flush();
eclipseの.projectコンテンツは、IProjectDescriptionインターフェイスを通じて公開されています。
IProjectDescription description = IProject.getDescription()
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