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私は、私は2番目のファイル、file2から特定の列を抽出するために使用する必要があるキーのファイル、file1、（新しいライン上の各キー）を持っています。ファイル1の長さは46行であり、file2ははるかに大きく、>20,000行です。 file1に表示されるすべてのキーがfile2に表示されるわけではなく、その逆もあります。awkを使用してキーに基づいてファイルから列を抽出する方法は？
FILE1：
322510472
322510472
322510472
322510484
322510484
322510484
322510493
FILE2：
109287879,Invertebrate_iridescent_virus_3,109287879,148,1,148,NCVOG0391,0
109287880,Invertebrate_iridescent_virus_3,109287880,458,1,458,,
109287881,Invertebrate_iridescent_virus_3,109287881,156,1,156,,
109287882,Invertebrate_iridescent_virus_3,109287882,451,1,451,NCVOG1423,0
109287883,Invertebrate_iridescent_virus_3,109287883,217,1,217,NCVOG4910,2
109287884,Invertebrate_iridescent_virus_3,109287884,494,1,494,NCVOG0211,0
109287885,Invertebrate_iridescent_virus_3,109287885,447,1,447,NCVOG1077,0
109287886,Invertebrate_iridescent_virus_3,109287886,347,1,347,NCVOG0967,2
両方file1とfile2列1及びfile2の3で表示されるキーでソートされています。
file2から第三
file1から私のキーを含むファイル、
file3、と同様に、列2と7を生成するために、と一致するエントリがに存在しない場合でも、
file1中に存在する任意のキーを省略しない必要
file2。
私は、キー、file1の私のファイルに46のエントリを持っていることを知っています。しかし、次のawkスクリプトを使用すると、出力は44行しか表示されません。
彼らは私もこれらのキーを含む他のファイルに保持する必要があり、実際のデータに対応して、私は、私のawkの出力で私のキーのいずれかを削除しないようにする必要があります。
提案がありますか？すべての助けをありがとう。私はしばらくの間、スタックのオーバーフローを読んできましたが、これは私の最初の質問です！
「$ 1 in a」条件は、両方のファイルのエントリにのみ当てはまります。一致しなかったものも印刷する必要があります。もしキーが一意であれば、それぞれのマッチの後に 'a'からキーを削除し、' END'ブロックの残りのキーを反復することができます。後でソートすることもできます。しかし、データがすでにソートされているので、ここでは 'join'が良い解決法です。 – karakfa
問題を実際に表現できるサンプルデータを提供する必要があります –