Rグラフをプロットして保存する

Question

私は、コマンドが実行されたときのメモリ使用量を追跡するbashスクリプトを持っています。それは所望のコマンドを生成し、次にcolumn1 = "プログラムによって使用中のメモリ（gigs）"というログを書き込み、カラム2はそれまでに経過した時間を秒で表します。例えば私が何をしたいか

31.282 1470 
31.565 1480 
31.848 1490 
31.989 1500 
32.273 1510 
32.414 1520 
32.697 1530 
32.980 1540 
33.122 1550 
33.405 1560 
6.511 1570 
6.935 1580 
7.502 1590 
7.926 1600 
8.351 1610 
8.775 1620 
9.059 1630 
9.483 1640 
9.908 1650 
10.333 1660 

は、プロセスが完了するまで待機し、その後、時間をかけてメモリ使用量のグラフをプロットし、現在のディレクトリに保存するためにRを使用しています。私はRで遊んでいたと私は私が使用する必要があるコマンドを正確に知る：

> heisenberg <- read.csv(file="4644.log",head=FALSE,sep=" ") 
> plot(heisenberg$V2,heisenberg$V1,type="o",col="red",main="Memory Usage Over Time",xlab="Time (seconds)",ylab="Memory (gigabytes)") 
> text(max(heisenberg$V2),max(heisenberg$V1),max(heisenberg$V1)) #Displays max value 

しかし、私はに引っかかってい一部がjpgまたはPNGとしてグラフを保存しています。または、私はどのように私のbashスクリプト内でこのコマンドを実行することができます。 R言語で書かれた別のスクリプトを絶対に実行して実行する必要がありますか？これはすべてを1つにすることは可能でしょうか？

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編集

ここに私のscript.r

png("mem_usage_2965.png",height=800,width=800) 
heisenberg <- read.csv(file="2965.log",head=FALSE,sep=" ") 
plot(heisenberg$V2,heisenberg$V1,type="o",col="red",main="oases_k85",xlab="Time (seconds)",ylab="Memory (gigabytes)") 
text(max(heisenberg),max(heisenberg),max(heisenberg)) 
dev.off() 

ためのコードである誰もがテキストを出力PNGの最大値を印刷しない理由として役立つことはできますか？私はbashのスクリプトのようにそれを呼び出していますR CMD BATCH script.r script.out

Answer 1

あなたのプロットがで呼び出しをラップ：

jpeg("myplot.jpg") 
....plot code here.... 
dev.off() 

または

png("myplot.png") 
....plot code here.... 
dev.off() 

を、それぞれのヘルプページを参照してください。他の引数の詳細については?png。

がPNGの場合、これは次のようになります。

png("my_plot.png", height = 800, width = 600) 
plot(heisenberg$V2,heisenberg$V1,type="o",col="red",main="Memory Usage Over Time",xlab="Time (seconds)",ylab="Memory (gigabytes)") 
text(max(heisenberg$V2),max(heisenberg$V1),max(heisenberg$V1)) #Displays max value 
dev.off() 

bashスクリプトでこれを実行しているとして、あなたは、データをロードし、プロットを描画するRコードを含むスクリプトを実行するために、Rを起動する必要があります。このためにいくつかのオプションがあり、2は以下のとおりです。

R CMD BATCH --no-save --no-restore my_script.R 

またはmy_script.Rはプロットを生成するために必要な構文的に有効なRコードを含むテキストファイルですRscript

Rscript my_script.R 

を使用しています。

Answer 2

あなたはただ単純に見ていますか？ http://stat.ethz.ch/R-manual/R-devel/library/grDevices/html/png.html

あなたは、基本的に.PNGの保存を開始するためにRを伝える：その後、

png(file="blah.png") 

使用：

dev.off() 

を通常の状態に戻ります。