パッケージclusterSimをロードしようとすると、Rは出力せずにフリーズします。私はRには新しく、この問題に対処する方法はわかりません。私はフォーラムやその他のドキュメントで助けを見つけられませんでした。'clusterSim'パッケージをOS x El CapitanでロードするときにRがフリーズする
- パッケージインストーラとRコンソールから:私は同じ結果と常に次の方法でこれを試してみた
> sessionInfo() R version 3.2.4 (2016-03-10) Platform: x86_64-apple-darwin13.4.0 (64-bit) Running under: OS X 10.11.3 (El Capitan) locale: [1] en_US.UTF-8/en_US.UTF-8/en_US.UTF-8/C/en_US.UTF-8/en_US.UTF-8 attached base packages: [1] stats graphics grDevices utils datasets methods base
:Rで
のSessionInfo()は次のような出力を提供しますコマンドラインから取得します。
- 端末から
- GUIとコンソールのR-Studioから。
R、R-Studio、パッケージ 'clusterSim'とその依存関係 'cluster'と 'MASS'を削除して再インストールしようとしました。ソースからパッケージ「clusterSim」をインストールしようとし、それがフリーズする前に、次の出力が生成され、
:
> install.packages('clusterSim', type='source')
Installing package into ‘/Users/marc/Library/R/3.2/library’
(as ‘lib’ is unspecified)
trying URL 'https://ftp.cixug.es/CRAN/src/contrib/clusterSim_0.44-2.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 4155487 bytes (4.0 MB)
==================================================
downloaded 4.0 MB
* installing *source* package ‘clusterSim’ ...
** package ‘clusterSim’ successfully unpacked and MD5 sums checked
** libs
clang++ -I/Library/Frameworks/R.framework/Resources/include -DNDEBUG -I/usr/local/include -I/usr/local/include/freetype2 -I/opt/X11/include -fPIC -Wall -mtune=core2 -g -O2 -c clusterSim.cpp -o clusterSim.o
clusterSim.cpp:31:19: warning: unused variable 'b' [-Wunused-variable]
double l1,m1,m2,a,b;
^
1 warning generated.
clang++ -dynamiclib -Wl,-headerpad_max_install_names -undefined dynamic_lookup -single_module -multiply_defined suppress -L/Library/Frameworks/R.framework/Resources/lib -L/usr/local/lib -o clusterSim.so clusterSim.o -F/Library/Frameworks/R.framework/.. -framework R -Wl,-framework -Wl,CoreFoundation
installing to /Users/marc/Library/R/3.2/library/clusterSim/libs
** R
** data
** inst
** preparing package for lazy loading
誰もが、このパッケージがロードされて得るために私を助けることができますか?コマンドを実行してパッケージをロードするときに出力を得る方法が分かっていたら、すでに役に立つかもしれません。
がhttps://www.xquartz.orgをインストールしてからRを再起動し、あなたがclustermsimをロードするときにRが凍結しない:
おかげで、
マルク・
パッケージのインストール時に "load"という単語が "install"されます。メッセージが示すフォルダを削除しようとしましたか? '/ Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.2/Resources/library/00LOCK-clusterSim' – lmo
バイナリを使ってパッケージをインストールできます。問題は、 'library( 'clusterSim')'セッションでそれを必要とするときにロードできないということです。フォルダを削除すると、 'type = 'source''オプションを指定してインストールを行うのに役立ちました。私はそれに応じて質問を編集した。 –