MySQLエラーを解決してデバッグする方法：ER_LOCK_WAIT_TIMEOUT：ロック待ちタイムアウトを超えました。トランザクションを再開しようとしてみてください

Question

私はこれについていくつかの記事を読んだことがありますが、それでもエラーを解決する方法はまだ分かりません。また、どのように私はshow engine innodb status出力を解読するのですか？私はそのデッドロックか、トランザクションをコミット/ロールバックして永久にロックを保持することになると思われます（これは可能でしょうか？）。

# show engine innodb status; 
===================================== 
2015-09-27 04:43:54 2b9cf470f700 INNODB MONITOR OUTPUT 
===================================== 
Per second averages calculated from the last 33 seconds 
----------------- 
BACKGROUND THREAD 
----------------- 
srv_master_thread loops: 16140 srv_active, 0 srv_shutdown, 3941554 srv_idle 
srv_master_thread log flush and writes: 3957687 
---------- 
SEMAPHORES 
---------- 
OS WAIT ARRAY INFO: reservation count 25915 
OS WAIT ARRAY INFO: signal count 25874 
Mutex spin waits 1675, rounds 50212, OS waits 1581 
RW-shared spins 24307, rounds 729240, OS waits 24278 
RW-excl spins 16, rounds 1680, OS waits 56 
Spin rounds per wait: 29.98 mutex, 30.00 RW-shared, 105.00 RW-excl 
------------ 
TRANSACTIONS 
------------ 
Trx id counter 712274 
Purge done for trx's n:o < 712178 undo n:o < 0 state: running but idle 
History list length 1593 
LIST OF TRANSACTIONS FOR EACH SESSION: 
---TRANSACTION 0, not started 
MySQL thread id 18286, OS thread handle 0x2b9cf470f700, query id 2307113 bb116-14-164-108.singnet.com.sg 116.14.164.108 meclub2359 init 
show engine innodb status 
---TRANSACTION 0, not started 
MySQL thread id 18285, OS thread handle 0x2b9cf4444700, query id 2306954 bb116-14-164-108.singnet.com.sg 116.14.164.108 meclub2359 cleaning up 
---TRANSACTION 712266, not started 
MySQL thread id 18270, OS thread handle 0x2b9cf43c2700, query id 2307088 172.31.8.174 meclub2359 cleaning up 
---TRANSACTION 712235, not started 
MySQL thread id 18268, OS thread handle 0x2b9cf3896700, query id 2306757 172.31.8.174 meclub2359 cleaning up 
---TRANSACTION 712268, not started 
MySQL thread id 18267, OS thread handle 0x2b9cf4381700, query id 2307091 172.31.8.174 meclub2359 cleaning up 
---TRANSACTION 712272, not started 
MySQL thread id 5214, OS thread handle 0x2b9cf31dd700, query id 2307112 localhost 127.0.0.1 rdsadmin cleaning up 
---TRANSACTION 712269, ACTIVE 31 sec starting index read 
mysql tables in use 1, locked 1 
LOCK WAIT 2 lock struct(s), heap size 360, 1 row lock(s) 
MySQL thread id 18288, OS thread handle 0x2b9cf44c6700, query id 2307092 172.31.8.174 meclub2359 updating 
UPDATE stardate SET winnersSelected=1 WHERE id='6' 
------- TRX HAS BEEN WAITING 31 SEC FOR THIS LOCK TO BE GRANTED: 
RECORD LOCKS space id 4067 page no 3 n bits 72 index `PRIMARY` of table `ebdb`.`stardate` trx id 712269 lock_mode X locks rec but not gap waiting 
Record lock, heap no 3 PHYSICAL RECORD: n_fields 16; compact format; info bits 0 
0: len 4; hex 00000006; asc  ;; 
1: len 6; hex 0000000addcd; asc  ;; 
2: len 7; hex 180000021d2d57; asc  -W;; 
3: len 30; hex 68747470733a2f2f73332d61702d736f757468656173742d312e616d617a; asc https://s3-ap-southeast-1.amaz; (total 62 bytes); 
4: len 30; hex 4d75736963616c204576656e696e67207769746820456c6c696520476f75; asc Musical Evening with Ellie Gou; (total 35 bytes); 
5: len 30; hex 4d75736963616c204576656e696e67207769746820456c6c696520476f75; asc Musical Evening with Ellie Gou; (total 35 bytes); 
6: len 30; hex 4d75736963616c204576656e696e67207769746820456c6c696520476f75; asc Musical Evening with Ellie Gou; (total 255 bytes); 
7: len 22; hex 53696e6761706f72650d0a4d6172696e612042617920; asc Singapore Marina Bay ;; 
8: len 20; hex 52443230313530394d434d4543444153434d5346; asc RD201509MCMECDASCMSF;; 
9: len 4; hex 80000002; asc  ;; 
10: len 5; hex 9997295000; asc )P ;; 
11: len 5; hex 999702a000; asc  ;; 
12: len 4; hex 8000000c; asc  ;; 
13: len 1; hex 81; asc ;; 
14: len 5; hex 999706e345; asc  E;; 
15: len 5; hex 99972ee820; asc . ;; 

------------------ 
---TRANSACTION 712213, ACTIVE 501 sec 
5 lock struct(s), heap size 1184, 1 row lock(s), undo log entries 3 
MySQL thread id 18284, OS thread handle 0x2b9cf3daa700, query id 2307007 172.31.8.174 meclub2359 cleaning up 
Trx read view will not see trx with id >= 712249, sees < 712141 
---TRANSACTION 712197, ACTIVE 574 sec 
5 lock struct(s), heap size 1184, 1 row lock(s), undo log entries 3 
MySQL thread id 18283, OS thread handle 0x2b9cf4403700, query id 2306959 172.31.8.174 meclub2359 cleaning up 
Trx read view will not see trx with id >= 712241, sees < 712141 
---TRANSACTION 712184, ACTIVE 595 sec 
5 lock struct(s), heap size 1184, 1 row lock(s), undo log entries 3 
MySQL thread id 18281, OS thread handle 0x2b9cf468d700, query id 2306856 172.31.8.174 meclub2359 cleaning up 
Trx read view will not see trx with id >= 712240, sees < 712141 
---TRANSACTION 712141, ACTIVE 935 sec 
7 lock struct(s), heap size 1184, 12 row lock(s), undo log entries 19 
MySQL thread id 18279, OS thread handle 0x2b9cf4485700, query id 2306383 172.31.8.174 meclub2359 cleaning up 
Trx read view will not see trx with id >= 712146, sees < 712146 
-------- 
FILE I/O 
-------- 
I/O thread 0 state: waiting for completed aio requests (insert buffer thread) 
I/O thread 1 state: waiting for completed aio requests (log thread) 
I/O thread 2 state: waiting for completed aio requests (read thread) 
I/O thread 3 state: waiting for completed aio requests (read thread) 
I/O thread 4 state: waiting for completed aio requests (read thread) 
I/O thread 5 state: waiting for completed aio requests (read thread) 
I/O thread 6 state: waiting for completed aio requests (write thread) 
I/O thread 7 state: waiting for completed aio requests (write thread) 
I/O thread 8 state: waiting for completed aio requests (write thread) 
I/O thread 9 state: waiting for completed aio requests (write thread) 
Pending normal aio reads: 0 [0, 0, 0, 0] , aio writes: 0 [0, 0, 0, 0] , 
ibuf aio reads: 0, log i/o's: 0, sync i/o's: 0 
Pending flushes (fsync) log: 0; buffer pool: 0 
562 OS file reads, 295536 OS file writes, 202242 OS fsyncs 
0.00 reads/s, 0 avg bytes/read, 0.24 writes/s, 0.18 fsyncs/s 
------------------------------------- 
INSERT BUFFER AND ADAPTIVE HASH INDEX 
------------------------------------- 
Ibuf: size 1, free list len 0, seg size 2, 0 merges 
merged operations: 
insert 0, delete mark 0, delete 0 
discarded operations: 
insert 0, delete mark 0, delete 0 
Hash table size 1241027, node heap has 2 buffer(s) 
0.06 hash searches/s, 0.27 non-hash searches/s 
--- 
LOG 
--- 
Log sequence number 87135734 
Log flushed up to 87135734 
Pages flushed up to 87135734 
Last checkpoint at 87135734 
0 pending log writes, 0 pending chkp writes 
133514 log i/o's done, 0.09 log i/o's/second 
---------------------- 
BUFFER POOL AND MEMORY 
---------------------- 
Total memory allocated 641744896; in additional pool allocated 0 
Dictionary memory allocated 264646 
Buffer pool size 38271 
Free buffers  20250 
Database pages  18019 
Old database pages 6631 
Modified db pages 0 
Pending reads 0 
Pending writes: LRU 0, flush list 0, single page 0 
Pages made young 423, not young 82 
0.00 youngs/s, 0.00 non-youngs/s 
Pages read 521, created 17502, written 131006 
0.00 reads/s, 0.00 creates/s, 0.12 writes/s 
Buffer pool hit rate 1000/1000, young-making rate 0/1000 not 0/1000 
Pages read ahead 0.00/s, evicted without access 0.00/s, Random read ahead 0.00/s 
LRU len: 18019, unzip_LRU len: 0 
I/O sum[4]:cur[0], unzip sum[0]:cur[0] 
-------------- 
ROW OPERATIONS 
-------------- 
0 queries inside InnoDB, 0 queries in queue 
4 read views open inside InnoDB 
Main thread process no. 14465, id 47953069967104, state: sleeping 
Number of rows inserted 55739, updated 14635, deleted 309, read 1463461 
0.00 inserts/s, 0.03 updates/s, 0.00 deletes/s, 35.00 reads/s 
---------------------------- 
END OF INNODB MONITOR OUTPUT 
============================ 

クエリが掛かっているように見えますか？ show processlist

の出力自分のアプリケーションでこれを原因とどこので、どのように私はより多くをデバッグするのですか？私はAWS RDS、Elastic Beanstalk、NodeJS/SailsJSを使用しています。

UPDATE

私はこの問題は一列のみで発生に気づきました。私がUPDATE stardate SET winnersSelected=1 WHERE id='6'にしようとすると。

UPDATE

私は、コードの変更は、接続工事を閉じることがわかりました。しかし、まだ興味がありますが、上の出力から何が原因なのかをどうすればわかりますか？私はそれが役に立つと思う。これが原因であるかどうかはわかりません。

は例えば、私はそう長く取っている

---TRANSACTION 0, not started 
MySQL thread id 18285, OS thread handle 0x2b9cf4444700, query id 2306954 bb116-14-164-108.singnet.com.sg 116.14.164.108 meclub2359 cleaning up 

---TRANSACTION 712235, not started 
MySQL thread id 18268, OS thread handle 0x2b9cf3896700, query id 2306757 172.31.8.174 meclub2359 cleaning up 

は、なぜそれがクリーンアップのように見えるん参照してください？私は心配すべきですか？

---TRANSACTION 712269, ACTIVE 31 sec starting index read 
mysql tables in use 1, locked 1 
LOCK WAIT 2 lock struct(s), heap size 360, 1 row lock(s) 
MySQL thread id 18288, OS thread handle 0x2b9cf44c6700, query id 2307092 172.31.8.174 meclub2359 updating 
UPDATE stardate SET winnersSelected=1 WHERE id='6' 
------- TRX HAS BEEN WAITING 31 SEC FOR THIS LOCK TO BE GRANTED: 
RECORD LOCKS space id 4067 page no 3 n bits 72 index `PRIMARY` of table `ebdb`.`stardate` trx id 712269 lock_mode X locks rec but not gap waiting 
Record lock, heap no 3 PHYSICAL RECORD: n_fields 16; compact format; info bits 0 
0: len 4; hex 00000006; asc  ;; 
1: len 6; hex 0000000addcd; asc  ;; 
2: len 7; hex 180000021d2d57; asc  -W;; 
3: len 30; hex 68747470733a2f2f73332d61702d736f757468656173742d312e616d617a; asc https://s3-ap-southeast-1.amaz; (total 62 bytes); 
4: len 30; hex 4d75736963616c204576656e696e67207769746820456c6c696520476f75; asc Musical Evening with Ellie Gou; (total 35 bytes); 
5: len 30; hex 4d75736963616c204576656e696e67207769746820456c6c696520476f75; asc Musical Evening with Ellie Gou; (total 35 bytes); 
6: len 30; hex 4d75736963616c204576656e696e67207769746820456c6c696520476f75; asc Musical Evening with Ellie Gou; (total 255 bytes); 
7: len 22; hex 53696e6761706f72650d0a4d6172696e612042617920; asc Singapore Marina Bay ;; 
8: len 20; hex 52443230313530394d434d4543444153434d5346; asc RD201509MCMECDASCMSF;; 
9: len 4; hex 80000002; asc  ;; 
10: len 5; hex 9997295000; asc )P ;; 
11: len 5; hex 999702a000; asc  ;; 
12: len 4; hex 8000000c; asc  ;; 
13: len 1; hex 81; asc ;; 
14: len 5; hex 999706e345; asc  E;; 
15: len 5; hex 99972ee820; asc . ;; 

は、私は、クエリUPDATE stardate SET winnersSelected=1 WHERE id='6'がブロックされていることを上記の出力から言うことはできますか？しかし、どうすればわかるのですか？

Answer 1

困難なMySQL診断の問題に対処する場合、かなり頻繁にgdbに頼らざるを得ません。

gdb -ex "set pagination 0" -ex "thread apply all bt" \ 
    --batch -p $(pidof mysqld) 

その後、あなたはスタックトレースのリストを掘ると、ソースの知識の少しであなたは何が起こっているか把握することができます：あなたはこのような何かを行うことができます。

長い「クリーンアップ」の原因は、別のスレッドによってどこかの重要なロックがかかっている可能性があります。その理由は数多くある可能性があります。スタックトレースを貼り付けると、何が起こっているのかを知ることができます。

InnoDBのデッドロックは実際には正当なシナリオです。これは、ある状況では、うまくいけばまれに、ロックアルゴリズムがデッドロックしていることがわかるように設計されています。この問題は、ロック待ちタイムアウトによって軽減されます。到達すると、トランザクションはデッドロックから抜け出すために中止されます。理論的には、理想的なInnoDBクライアントコードは、デッドロックのために失敗した場合、すべてのトランザクションを再試行するように記述する必要があります。実際には、この原則に準拠するために大きなコードベースをリファクタリングすることは非常に難しいかもしれませんが、いくつかの重要な戦いを選び、順守するために最も面倒なコードをリファクタリングすることをお勧めします。

デッドロックを回避するには、トランザクションを頻繁にコミットし、予測不可能な順序でレコードを更新しないようにします。これには、当然のことながら、接続の適切なクリーンアップが含まれます。あなたが接続を終了していない場合、あなたはこのような一見無害なシナリオかもしれない：

長時間
• は全く活性
• を選択しないBEGIN

を問題は、トランザクションということですSELECTで読み取った行をロックし、COMMIT/ROLLBACKまでそれらのロックを解除しません。

クリーンアップが難しい乱雑なコードがたくさんある場合は、接続プールの使用を中止することを検討してください。 MySQLは非常に低いセッション開始オーバーヘッドを持ち、頻繁に再接続することができます。この方法では、非アクティブな接続は自動的にアプリケーション要求の終了時に閉じられます（多数のアプリケーションで共通するコードについていくつかのことを想定しています）。その状態の接続プール

Answer 2

デッドロックのためにトランザクションが失敗した場合は、必ずトランザクションを再発行する準備をしてください。デッドロックは危険ではありません。もう一度やり直してください。私は、あなたがロック待機時間を増やしてみてくださいすることができます

https://dev.mysql.com/doc/refman/5.0/en/innodb-deadlocks.html