クラスmle-classのRオブジェクトに格納されている推定パラメータをどのように抽出するのか疑問に思っていました。ここでR:クラス 'mle'のオブジェクトからestmatesを抽出
は一例です。
x <- matrix(rnorm(300), ncol = 3)
x[x > 1] <- 1
require(tmvtnorm)
fit1 <- mle.tmvnorm(X = x, lower = rep(-Inf, 3), upper = rep(1, 3))
さて、FIT1は、クラスのオブジェクトです:
class(fit1)
[1] "mle"
attr(,"package")
[1] "stats4
「 FIT1自体は私を与える:
fit1
Call:
mle(minuslogl = function (mu_1 = 0, mu_2 = 0, mu_3 = 0, sigma_1.1 = 1,
sigma_1.2 = 0, sigma_1.3 = 0, sigma_2.2 = 1, sigma_2.3 = 0,
sigma_3.3 = 1)
{
nf <- names(formals())
theta <- sapply(nf, function(x) {
eval(parse(text = x))
})
mean <- theta[1:n]
if (cholesky) {
L <- inv_vech(theta[-(1:n)])
L[lower.tri(L, diag = FALSE)] <- 0
sigma <- t(L) %*% L
}
else {
sigma <- inv_vech(theta[-(1:n)])
}
if (det(sigma) <= 0 || any(diag(sigma) < 0)) {
return(.Machine$integer.max)
}
f <- -(sum(dmvnorm(X, mean, sigma, log = TRUE)) - nrow(X) *
log(pmvnorm(lower = lower, upper = upper, mean = mean,
sigma = sigma)))
if (is.infinite(f) || is.na(f)) {
return(.Machine$integer.max)
}
f
}, start = as.list(c(0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 1)), method = "BFGS",
fixed = list())
Coefficients:
mu_1 mu_2 mu_3 sigma_1.1 sigma_1.2 sigma_1.3
0.64218198 1.51720543 0.97047201 1.73395947 -0.03889188 0.14627774
sigma_2.2 sigma_2.3 sigma_3.3
2.18020597 0.38822509 1.49854600
私の質問は次のとおりです。これらの係数をオブジェクトfit1からどのように抽出するのですか?
お返事ありがとうございました。
私の答えは 'coef'を使ってください。あなたは答えを知っている時あなた自身を憎むでしょう! – fuzz
Btwの場合、logLike関数は負の対数尤度の対数を計算します(minusloglはmleオブジェクトに格納されているものです)。 – user3236841
は私の質問に答える:logLikeが(正)対数尤度を返し、オブジェクト内のminusloglがのろわれたことが表示されます。 – user3236841