返されたh5pyオブジェクトインスタンスにアクセスできない

Question

ここでは非常に奇妙な問題があります。私は、h5pyを使って作成したHDF5ファイルを読み込む関数と、前の関数から返された内容を連結する新しいHDF5ファイルを作成する関数の2つの関数を持っています。

def read_file(filename): 
    with h5py.File(filename+".hdf5",'r') as hf: 

     group1 = hf.get('group1') 
     group1 = hf.get('group2')    
     dataset1 = hf.get('dataset1') 
     dataset2 = hf.get('dataset2') 
     print group1.attrs['w'] # Works here 

     return dataset1, dataset2, group1, group1 

、今の問題は、データセットと作成し、WD1、WD2、WG1とWG2に代表される新しいファイルのプロパティは、私がアクセスすることができているファイル機能

def create_chunk(start_index, end_index): 

    for i in range(start_index, end_index): 
     if i == start_index: 
      mergedhf = h5py.File("output.hdf5",'w') 
      mergedhf.create_dataset("dataset1",dtype='float64') 
      mergedhf.create_dataset("dataset2",dtype='float64') 

      g1 = mergedhf.create_group('group1') 
      g2 = mergedhf.create_group('group2') 

    rd1,rd2,rg1,rg2 = read_file(filename) 

    print rg1.attrs['w'] #gives me <Closed HDF5 group> message 

    g1.attrs['w'] = "content" 
    g1.attrs['x'] = "content" 
    g2.attrs['y'] = "content" 
    g2.attrs['z'] = "content" 
    print g1.attrs['w'] # Works Here 
return mergedhf.get('dataset1'), mergedhf.get('dataset2'), g1, g2 

def calling_function(): 
    wd1, wd2, wg1, wg2 = create_chunk(start_index, end_index) 
    print wg1.attrs['w'] #Works here as well 

を作成し、私は属性データにアクセスすることができますが、私はそれを読み込んで値を返すことはできません。

呼び出し元関数への参照を返したときに、誰でもデータセットとグループの値を取得する手助けがありますか？

Answer 1

問題は、read_fileこのラインである：

with h5py.File(filename+".hdf5",'r') as hf: 

これは即ちときread_file戻り、withブロックの終わりにhfを閉じます。これが起こると、データセットとグループも閉じられ、アクセスできなくなります。

これを修正するには少なくとも2つの方法があります。

hf = h5py.File(filename+".hdf5", 'r') 

をし、それを閉じる前に、限り、あなたはそれを必要と周りhfへの参照を保持：あなたがcreate_chunkで行うようにまず、あなたはファイルを開くことができ

hf.close() 

他の方法はにありますread_fileでのデータセットからデータをコピーして、それらを返す：あなたはグループでこれを行うことはできません

dataset1 = hf.get('dataset1')[:] 
dataset2 = hf.get('dataset2')[:] 

注意を。あなたはグループで何かをする必要がある限り、ファイルを開く必要があります。