intraclass correlation (ICC)をPythonで計算しようとしています。私はこの機能を持つ既存のモジュールを見つけることができませんでした。別の名前がありますか、それとも自分でする必要がありますか？私はこの質問が他のユーザーによって検証されたクロスでa year agoと尋ねられたことを知っていますが、回答はありませんでした。私は2人の評価者の間で連続スコアを比較しようとしています。Pythonモジュールのクラス内相関？
での実装を見つけることができます。これらはPythonからrpy2パッケージ経由で使用できます。例：
from rpy2.robjects import DataFrame, FloatVector, IntVector
from rpy2.robjects.packages import importr
from math import isclose
groups = [1, 1, 1, 1, 2, 2, 2, 2, 3, 3, 3, 3, 4, 4, 4,
4, 5, 5, 5, 5, 6, 6, 6, 6, 7, 7, 7, 7, 8, 8, 8, 8]
values = [1, 2, 0, 1, 1, 3, 3, 2, 3, 8, 1, 4, 6, 4, 3,
3, 6, 5, 5, 6, 7, 5, 6, 2, 8, 7, 7, 9, 9, 9, 9, 8]
r_icc = importr("ICC")
df = DataFrame({"groups": IntVector(groups),
"values": FloatVector(values)})
icc_res = r_icc.ICCbare("groups", "values", data=df)
icc_val = icc_res[0] # icc_val now holds the icc value
# check whether icc value equals reference value
print(isclose(icc_val, 0.728, abs_tol=0.001))
[this]（http://stats.stackexchange.com/q/63368/61867）の質問には、いくつかのコードが含まれています。私はnumpyでかなりの機能に精通していますが、以前はICCを見ていません。また、scikit-learnパッケージとstatsmodelsパッケージのドキュメントを検索することもできます。いずれにせよ、手で実装するのは難しくはありません。速度が重要である場合は、特にnumpyの使用を検討してください。あなたの答えをここに投稿して、他の人がこれを探しているのを助けることを忘れないでください！ – Praveen
ありがとうPraveen。それがWalRが提供したものです。この時点で、自分で書く方が早いでしょう。 Pythonでインプリメンテーションを検索すると、ICCのために出てくるほとんどの結果はインテルC++コンパイラでした。私はそれがneurolearnに埋もれているのを発見していなかった。誰かがscipy/numpyでICCを完全に実装すると便利かもしれません。私が使用する実装やコードをフォローアップします。 – Hector