新しいファイルへのデータの読み書きPython

Question

別のファイルから読み込むことによって、新しいファイルに部分文字列を書き込む必要があります。私が直面している問題は、最後に見つかった部分文字列しか書いていないことです。 これは私が試みたものです。あなたがファイルを毎回再作成wモードで内部のファイルを開いたためだ

def get_fasta(site): 

with open('file1.txt', 'r') as myfile: 
     data=myfile.read() 
     site = site-1 
     str1 = data[site:site+1+20] 
     temp = data[site-20:site] 
     final_sequence = temp+str1 
     with open('positive_results_sequences.txt', 'w') as my_new_file: 
      my_new_file.write(final_sequence + '\n') 
def main(): 
    # iterate over the list of IDS 
    for k,v in zip(site_id_list): 
     get_fasta(v) 

if __name__ == '__main__': 
    main() 

Answer 1

。最終的な結果は最後の書き込みだけが続くことです。 aモード（「追加」を意味します）を使用します。

また、コードには他にもいくつか問題があります。たとえば、各ループ反復で両方のファイルを開いたり閉じたりします。ファイルのオープンコードを外側に移動し、パラメータとして渡す必要があります。

def main(): 
    with open('file1.txt', 'r') as myfile: 
     with open('positive_results_sequences.txt', 'a') as my_new_file: 
      for k,v in zip(site_id_list): 
       get_fasta(v, myfile, my_new_file)