のLinux - ファイル内の検索テキストと別のファイルに

Question

に参加し、私は2つのテキストファイルがあります。

File-1：

PRKCZ 
TNFRSF14 
PRDM16 
MTHFR 

File-2（2つのタブ区切りの列が含まれています）：

atherosclerosis GRAB1|PRKCZ|TTN 
cardiomyopathy,hypercholesterolemia PRKCZ|MTHFR 
Pulmonary arterial hypertension,arrhythmia PRDM16|APOE|GATA4 

を今度は、File-1という名前のそれぞれに対応する疾患名もFile-2から出力します。私はコードを試してみました

PRKCZ atherosclerosis,cardiomyopathy,hypercholesterolemia 
PRDM16 Pulmonary arterial hypertension,arrhythmia 
MTHFR cardiomyopathy,hypercholesterolemia 

：だから、出力は次のようになり

$ awk '{k=$1} 
     NR==FNR{if(NR>1)a[k]=","b"="$1";else{a[k]="";b=$1}next} 
     k in a{print $0a[k]}' File1 File2 

が、私は何も所望の出力を得られません。誰でも修正/助けてください。

Answer 1

あなたは以下のawkスクリプトでこれを行うことができます：

BEGIN { FS="[\t]" } 
NR==FNR { split($2, tmp, "|") 
      for(ind in tmp) { 
      name = tmp[ ind ] 
      if (name in disease) { disease[ name ] = disease[ name ] "," $1 } 
      else { disease[ name ] = $1 } 
      } 
      next 
     } 

     { if($1 in disease) print $1, disease[ $1 ] } 

script.awkこのawk -f script.awk File-2 File-1（最初File-2に注意してください）のようにそれを使用してください。

説明：

BEGIN
• ブロックがセパレータとしてタブを設定します。
• NR == FNRブロックが最初の引数（File-2）に対して実行される：それは、名前の疾患を読み取る名前を分割した後（最後のブロックのみが実行される
• 名のそれぞれの下に辞書に疾患を追加します前のブロックのnextのために）第2引数（File-1）のために保存されます：$1から取られた