awkコマンドの2つの変数

Question

基本的には、染色体番号（chr1、chr2、chr3 ...）に従ってlib1.vhを分割します。 しかしPlzは下記を参照してください

... 2つの変数があるコマンド、およびそれが動作しないのawkに思える：

cd /home/xug/scratch/mrfast/NA12891/ 
CHROM_NAME=`head -$c list_chr|tail -1` 

cat lib1.vh|awk '{if ($2==$CHROM_NAME) print}' 

をその後、私は何をすべき？ thx

こんにちは： 私はこのようにして動作します！

cat lib1.vh|awk -v src=$CHROM_NAME '{if ($2==src) print}' > lib1_$CHROM_NAME.vh 

Answer 1

CHROM_NAMEはシェル変数であるが、変数の置換シェル'single quoted strings'得ることはありません。

はおそらく、あなたは意味：

cd /home/xug/scratch/mrfast/NA12891/ 
CHROM_NAME=`head -$c list_chr|tail -1` 

cat lib1.vh|awk "{if (\$2==$CHROM_NAME) print}" 

Answer 2

環境変数は、ENVIRON連想配列の要素として表示されます。代わりに：

$CHROM_NAME 

あなたが欲しい：

ENVIRON["CHROM_NAME"]