近親交配係数計算と系譜ソフトウェア

Question

私は現在、非常に多数のGEDCOMファイル（約33,000人）をマッピングすることができるソフトウェアを探しています。また、祖先と個々の近親交代係数を計算します。誰もが可能なソフトウェアを知っていますか？

おかげ

Answer 1

私はあなたがあなたのためにこれを行う任意のソフトウェアを見つけるだろうとは思わないが、あなた自身を書くには余りにも困難ではないでしょう。多くのオープンソースのgedcomパーサーのうちの1つを取り出して、Neo4jなどのグラフデータベースに追加します。 Neo4jに入ったら、個人の計算を実行するのは比較的簡単です。

Answer 2

GeneWeb（MLで書かれた）は大きなファイルを非常にうまく処理し、速い子孫係数計算を持っています。私はそれがインポート時にデータベース内のすべての個人の下位係数を計算すると信じており、これは数秒以内にこれを行います。また、任意の深い祖先と子孫の木を目立たない遅延なく表示します。

http://cristal.inria.fr/~ddr/GeneWeb/en/index.html#Par

またGEDCOMsの任意の数を扱うことができます。

Answer 3

あなたは家系、家系の簡単な可視化、および血統から遺伝的多様性の指標の計算を操作するためのツールを提供PythonモジュールですPypedalPythonの血統分析に興味があるかもしれません。