私はPython 2.6をMATLAB(7.12)に埋め込むことを試みています。私はCで書かれたmexファイルを埋め込みたいと思っていました。これはスカラーを使った小さな簡単な例でうまくいきました。しかし、Numpy(1.6.1)をインポートしても、MATLABはクラッシュします。MATLABにPythonを埋め込む
:MEXファイルにPyRun_SimpleString
で
from numpy import *
:私はPythonのモジュール(の.py)で
含むnumpyのライブラリをロードするためのいくつかの方法を試してみましたので、私はとにかく言います
PyRun_SimpleString(“from numpy import *”);
ビジュアルで/ MD(マルチスレッド)スイッチを使用してコマンドラインからコンパイルされているシンプルなCファイルに埋め込まれたときPy_oBject_CallObject
でnumpyの関数を呼び出す:pOut = PyObject_CallObject(pFunc, pArgs);
もともと、私はこれはしかしC.でnumpyのを埋め込むに問題があるかもしれ考え、numpyのが正常に動作しますスタジオ2005 Cコンパイラ。次に、私は/ MDスイッチを含むようにMATLABのmakeファイルを変更すると考えました。そのような運がないと、mexopts.batは/ MDスイッチでコンパイルされます。 Numpy initモジュールの行を手動でコメントアウトして、MATLABがクラッシュしていたものを見つけました。拡張子pydのファイルをロードすると、MATLABがクラッシュするようです。 NumPyにロードされる最初のファイルはmultiarray.pydです。 MATLABのドキュメントでは、私が行ったVisual Studioでmexファイルをデバッグする方法と、そのエラーメッセージを以下に示しました。この時点で私は問題がpydのメモリ問題であり、MATLABとのいくつかの競合であることを知っています。興味深いことに、MATLABのシステムコマンドを使用して、numpyを使用するPythonでプロセスを開始し、エラーは生成されません。私はMATLABのエラーメッセージの下に貼り付け、続いてMATLABをクラッシュさせるプロセスのビジュアルスタジオでDEBUG出力を貼り付けます。しかし、最初の例外のリストが非常に長いので、私は全部を貼り付けていません。この統合の問題を解決するための提案はありますか?
MATLAB error
Matlab has encountered an internal problem and needs to close
MATLAB crash file:C:\Users\pml355\AppData\Local\Temp\matlab_crash_dump.3484-1:
------------------------------------------------------------------------
Segmentation violation detected at Tue Oct 18 12:19:03 2011
------------------------------------------------------------------------
Configuration:
Crash Decoding : Disabled
Default Encoding: windows-1252
MATLAB License : 163857
MATLAB Root : C:\Program Files\MATLAB\R2011a
MATLAB Version : 7.12.0.635 (R2011a)
Operating System: Microsoft Windows 7
Processor ID : x86 Family 6 Model 7 Stepping 10, GenuineIntel
Virtual Machine : Java 1.6.0_17-b04 with Sun Microsystems Inc. Java HotSpot(TM) Client VM mixed mode
Window System : Version 6.1 (Build 7600)
Fault Count: 1
Abnormal termination:
Segmentation violation
Register State (from fault):
EAX = 00000001 EBX = 69c38c20
ECX = 00000001 EDX = 24ae1da8
ESP = 0088af0c EBP = 0088af44
ESI = 69c38c20 EDI = 24ae1da0
EIP = 69b93d31 EFL = 00010202
CS = 0000001b DS = 00000023 SS = 00000023
ES = 00000023 FS = 0000003b GS = 00000000
Stack Trace (from fault):
[ 0] 0x69b93d31 C:/Python26/Lib/site-packages/numpy/core/multiarray.pyd+00081201 (???+000000)
[ 1] 0x69bfead4 C:/Python26/Lib/site-packages/numpy/core/multiarray.pyd+00518868 (???+000000)
[ 2] 0x69c08039 C:/Python26/Lib/site-packages/numpy/core/multiarray.pyd+00557113 (???+000000)
[ 3] 0x08692b09 C:/Python26/python26.dll+00076553 (PyEval_EvalFrameEx+007833)
[ 4] 0x08690adf C:/Python26/python26.dll+00068319 (PyEval_EvalCodeEx+002255)
This error was detected while a MEX-file was running. If the MEX-file
is not an official MathWorks function, please examine its source code
for errors. Please consult the External Interfaces Guide for information
on debugging MEX-files.
If this problem is reproducible, please submit a Service Request via:
http://www.mathworks.com/support/contact_us/
A technical support engineer might contact you with further information.
Thank you for your help.
ビジュアルスタジオのデバッガからの出力
First-chance exception at 0x0c12c128 in MATLAB.exe: 0xC0000005: Access violation reading location 0x00000004.
First-chance exception at 0x0c12c128 in MATLAB.exe: 0xC0000005: Access violation reading location 0x00000004.
First-chance exception at 0x0c12c128 in MATLAB.exe: 0xC0000005: Access violation reading location 0x00000004.
First-chance exception at 0x751d9673 in MATLAB.exe: Microsoft C++ exception: jitCgFailedException at memory location 0x00c3e210..
First-chance exception at 0x751d9673 in MATLAB.exe: Microsoft C++ exception: jitCgFailedException at memory location 0x00c3e400..
First-chance exception at 0x69b93d31 in MATLAB.exe: 0xC0000005: Access violation writing location 0x00000001.
> throw_segv_longjmp_seh_filter()
throw_segv_longjmp_seh_filter(): invoking THROW_SEGV_LONGJMP SEH filter
> mnUnhandledWindowsExceptionFilter()
MATLAB.exe has triggered a breakpoint
これはおそらく追跡が容易ではないでしょう。考えられる理由は、複数のCランタイムライブラリ(Pythonの場合は1つ、Matlabの場合は1つ、おそらくNumpyの場合は1つ)を読み込むこととの競合です。最初の提案:あなたはどんな.pydファイルもクラッシュすると言う。あなたはナンシーからではないものを試しましたか?最初のステップは、この基本的な部分を動作させることです。その後、Numpy(これはより複雑です)を動作させることに移ります。(これを解決するにはあまりにも多くの作業が必要な場合は、計画BはPythonを別のプロセスで実行し、IPCメソッドを使用してMatlabと通信することになります) –
良い点。あなたが言及する最初のオプションは、グラウンドへの.pydスレッドの後です。しかし、それはCコンパイルされたpydファイルを調べて、おそらく書き直すことを伴うかもしれません。 Pythonとの互換性のために以前の形式で保存されていなければならない)MATLABに.matファイルを保存するには1行のコードが必要です( 'data'、 'variable'、-v7 'を保存します) Python(variable = loadmat( 'data.mat'))をScipyパッケージ(scipy.io import loadmatから)に置き換えます。また、PythonでMATLAB関数をラップする方法についてもっと詳しく書かれているようですが、これは私が試してみるものです。 –
私は埋め込みを避ける方が良い方法だと言います。数年前、私はMatlabの中にPythonを埋め込んだMEXファイルを書いて、すべてがうまく動作するようにしました。 (バイナリのPythonモジュール(.pyd/.so)もそこにロードされていましたが、解決できる問題がいくつかありました。しかし、Matlabの次のバージョンではうまく機能しませんでした---全体的に、かなり壊れやすいセットアップのように感じました。 –