Rのデータフレームからデータ行を選択する方法は？

Question

これは初めての質問ですので、フォーマットが最適でない場合は事前にお詫びしてください。

私は2列に約6,000行のデータを持つデータフレームを持っており、個々の行（および複数の行をまとめて）を棒グラフに引き出したいと考えています。

私はデータフレームとしての私のファイルを読んで、ここではごく一部です：

gene  log2 
1 SMa0002 0.457418 
2 SMa0005 1.116950 
3 SMa0007 0.686749 
4 SMa0009 0.169450 
5 SMa0011 0.393365 
6 SMa0013 0.601940 

それでは、私が行うことができるようにしたいでしょうしても、x軸は遺伝子の数であるbarplotを持っています（SMaXXX、SMaXXX、SMaXXXなど）、y軸はlog2列です。値は（+）の値しか表示されませんが、（ - ）の値もあります。私はgplot2や他のプロッタでbarplotやgeom_barを使うかどうかについて本当の好みはありません。

私はデータフレームをプロットする方法を知っています。

ggplot(df, aes(x = gene, y = log2)) + geom_bar(stat = "identity") 

「マッチ」を使用して試してみましたが、その作業を行う方法を理解できませんでした。理想的にはコードは汎用性があるので、さまざまなプロットを生成するために異なるSMaXXXXコードを打ち込むことができます。

読んでいただきありがとうございます！

Answer 1

プロットするときにdata.frameをサブセット化する方法が必要なようです。前 1°）ggplot2

ggplot(df, aes(x = gene, y = log2)) + geom_bar(stat = "identity") + 
    scale_x_discrete(limits=subset.genes) 

2°）内側：：

df=data.frame(gene=c("SMa0002","SMa0005","SMa0006","SMa0007","SMa0011","SMa0013"), 
       "log2"=runif(6), stringsAsFactors=F) 
subset.genes=sample(unique(df$gene), 4, replace=F) 

方法のカップル：あなたは、ベクトルあなたがプロットする必要がある遺伝子のsubset.genesを持っていると仮定し しましょう

df2 <- subset(df, gene %in% subset.genes) 
ggplot(df2, aes(x = gene, y = log2)) + geom_bar(stat = "identity")