2017-10-18 4 views
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私のソリューションを、私はセレノシステインとロゴを作成したいが、私はreduced_protein_alphabetでオプションを選択したとき、私はWeblogo - セレノシステインアルファベット

weblogo -f sc.txt -D fasta -o sc_logo -F pdf -a reduced_protein_alphabet -s large -n 100 -c chemistry 
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クロス投稿:https://bioinformatics.stackexchange.com/questions/2661 – Pierre

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入力ファイルを追加できますか? –

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私はできません、それは機密ではありません – MTG

答えて

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エラー「Repetativeアルファベット」を取得:私は

    をやった。ここ
  1. infileにエラーがないかどうか確認してください。

  2. は、このアルファベット-Cで

  3. カラーアミノ酸100 -n

    weblogo -f sc.txt -D FASTA -oロゴ-FのPDFの-aオプションにアルファベット 'ACDEFGHIKLMNPQRSTVUWY' を追加します - タンパク質-A 'ACDEFGHIKLMNPQRSTVUWY' -s大-C黄色Uのセレノシステイン-C赤DE酸性-CブラックAVLIPWFM疎水-C青色KRH基本-C紫QN中立-C緑色GSTYC極性

I」がなかったのそれは簡単です。多分それは誰かを助けるでしょう!