別のファイルの文字と一致する行を書き込む

Question

本質的には、コードで参照されるIDリストに一致するドキュメントの行を書きたい。

nodeIDs.txt：

...

10000 
10023 
1017 
1019 
1021 
1026 
1027 
1029 
... 

アドヘレンjunction.txt、417個のオブジェクト有する：

を...は

、73行を有します

4301: AFDN; afadin, adherens junction formation factor 
1496: CTNNA2; catenin alpha 2 
283106: CSNK2A3; casein kinase 2 alpha 3 
2241: FER; FER tyrosine kinase 
60: ACTB; actin beta 
1956: EGFR; epidermal growth factor receptor 
56288: PARD3; par-3 family cell polarity regulator 
10458: BAIAP2; BAI1 associated protein 2 
51176: LEF1; lymphoid enhancer binding factor 1 

私はプログラムを行ごとに実行し、idリストを参照し、行の先頭文字がリスト内にある文字のいずれかと一致していれば、その行を新しいドキュメントに書き込もうとしています。私はデータセットを研究していましたが、ここでうまくいくかどうかは分かりませんでした。これまで

マイコード：

ids = [] 
with open('nodeIDs.txt', 'r') as n: 
    for line in n: 
     ids.append(line) 
n.close() 

# Import data from the pathway file and turn into a list 
g = [] 
with open('Adherens junction.txt', 'r') as a: 
    for line in a: 
     g.append(line) 
a.close() 

aj = open('Adherens.txt', 'a') 
for line in a: 
    if ids[i] in line: 
    aj.write(line) 
aj.close() 

はあなたが私はこの作業を得るのを助けることはできますか？

Answer 1

あなたが何をしていると思いますか？

コード：

# read ids file into a set 
with open('file1', 'r') as f: 
    # create a set comprehension 
    ids = {line.strip() for line in f} 

# read the pathway file and turn into a list 
with open('file2', 'r') as f: 
    # create a list comprehension 
    pathways = [line for line in f] 

# output matching lines 
with open('file3', 'a') as f: 

    # loop through each of the pathways 
    for pathway in pathways: 

     # get the number in front of the ':' 
     start_of_line = pathway.split(':', 1)[0] 

     # if this is in 'ids' output the line 
     if start_of_line.strip() in ids: 
      f.write(pathway) 

結果：

2241: FER; FER tyrosine kinase 
56288: PARD3; par-3 family cell polarity regulator 

FILE1：

10000 
56288 
2241 

FILE2：

4301: AFDN; afadin, adherens junction formation factor 
1496: CTNNA2; catenin alpha 2 
283106: CSNK2A3; casein kinase 2 alpha 3 
2241: FER; FER tyrosine kinase 
60: ACTB; actin beta 
1956: EGFR; epidermal growth factor receptor 
56288: PARD3; par-3 family cell polarity regulator 
10458: BAIAP2; BAI1 associated protein 2 
51176: LEF1; lymphoid enhancer binding factor 1 

セットの理解とは何ですか？

これ：

# create a set comprehension 
ids = {line.strip() for line in f} 

と同じである：この質問は大幅で改善されるであろう