Trimmomaticではスライディングウィンドウのデフォルト値はありますか？

Question

スライディングウインドウなしでAVGQUAL：20のコマンドを与えると、スライディングウインドウのデフォルト値が設定されますか？

Answer 1

トリムママティックウェブサイトhttp://www.usadellab.org/cms/?page=trimmomaticを確認すると、そこにマニュアルがあります。手動で

はAVGQUALため言う：このステップは、すべての資質を合計しきい値に達しているか否かの長さをチェックすることによって分割し、その後、低下または保持するようにAVGQUAL: Drop the read if the average quality is below the specified level

。したがってないウィンドウは、必要とされません読む。