2016-04-27 9 views
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私は肝臓腫瘍を体外CTスキャンから3次元でセグメント化しようとしています。現在のところ、私は70%という低い精度を持っています。シンプリティックで関心領域を設定する

正確さを高める私の計画は、肝臓全体をセグメント化し、それを関心領域として設定し、肝臓内の腫瘍をセグメント化することです。しかし、私が抱えている問題は、私が使っているスレッシュホールド方法(近傍接続フィルタ、バイナリスレッショルドイメージフィルタなど)がセグメンテーション内の値を白(255)、外が黒(0)に設定してしまうことです。

私は外のボクセルを黒に設定できますが、肝臓のボクセルには触れない方法はありますか?私はsitkのドキュメントを読んできましたが、私はこれを行うのに役立つフィルターを見つけるのに問題があります。

答えて

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まずはSimpleITKでマスクと多くのセグメンテーションが0と0のバイナリになるのが一般的です。したがって、出力が0と255であることを再度確認してください。セグメンテーションアルゴリズムを変更して、これを出力として生成することができます。

グレースケール画像を「黒くする」マスク画像の値を設定できるMaskImageFilterを使用できます。

両方の画像が同じタイプで、マスク画像が0と1の場合、画像を単純に乗算できます。

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