2017-07-19 9 views
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私は、時間の経過とともに数多くの集団(種、場所などが異なる)の相関があります。どのように統計的にこれらの相関関係を(それぞれのグループについて)分析することができますか?Rの多くの相関関係を比較する

私は、600 +相関のそれぞれについてp値、CI、相関係数を持っていますが、これらをグループ(種、場所など)内でどのように比較できますか?

母集団番号(年)と年、種族と場所(ダミー変数に変えられる)との相関関係を、家族内での相関をとるときの制御因子として、そして場所(ダミー変数)を種内で相関させる際の制御変数として使用するが、それが正しいかどうかは不明である。ここで

は、いくつかのサンプルデータであるが、これはより多くの物流の問題である実際のデータの問題に反対する:

Location Species     Year Section Total Percent Family 
Chiswell A Black-legged Kittiwake 1976 Central 310 16.78397401 Gull 
Chiswell A Black-legged Kittiwake 1986 Central 982 53.16729832 Gull 
Chiswell A Black-legged Kittiwake 1989 Central 555 30.04872767 Gull 
Chiswell B Common Murre   1976 Central 150 20.6043956 Auk 
Chiswell B Common Murre   1986 Central 385 52.88461538 Auk 
Chiswell B Common Murre   1991 Central 193 26.51098901 Auk 
Natoa Is Black-legged Kittiwake 1976 Central 70 12.77372263 Gull 
Natoa Is Black-legged Kittiwake 1986 Central 168 30.65693431 Gull 
Natoa Is Black-legged Kittiwake 1989 Central 310 56.56934307 Gull 
Wooded Is Black-legged Kittiwake 1972 Central 1560 13.35159192 Gull 
Wooded Is Pelagic Cormorant  1972 Central 144 45.56962025 Cormorant 
Wooded Is Black-legged Kittiwake 1976 Central 2350 20.11297501 Gull 
Wooded Is Glaucous-winged Gull 1976 Central 150 13.83763838 Gull 
Wooded Is Horned Puffin   1976 Central 30 33.33333333 Auk 
Wooded Is Pelagic Cormorant  1976 Central 44 13.92405063 Cormorant 
Wooded Is Pigeon Guillemot  1976 Central 100 37.59398496 Auk 
Wooded Is Red-faced Cormorant  1976 Central 4 66.66666667 Cormorant 
Wooded Is Tufted Puffin   1976 Central 9600 98.21976673 Auk 
Wooded Is Black-legged Kittiwake 2000 Central 5587 47.81752824 Gull 
Wooded Is Glaucous-winged Gull 2000 Central 472 43.54243542 Gull 
Wooded Is Horned Puffin   2000 Central 30 33.33333333 Auk 
Wooded Is Pelagic Cormorant  2000 Central 64 20.25316456 Cormorant 
Wooded Is Pigeon Guillemot  2000 Central 83 31.20300752 Auk 
Wooded Is Red-faced Cormorant  2000 Central 1 16.66666667 Cormorant 
Wooded Is Tufted Puffin   2000 Central 87 0.890116636 Auk 
Wooded Is Black-legged Kittiwake 2001 Central 2187 18.71790483 Gull 
Wooded Is Glaucous-winged Gull 2001 Central 462 42.6199262 Gull 
Wooded Is Horned Puffin   2001 Central 30 33.33333333 Auk 
Wooded Is Pelagic Cormorant  2001 Central 64 20.25316456 Cormorant 
Wooded Is Pigeon Guillemot  2001 Central 83 31.20300752 Auk 
Wooded Is Red-faced Cormorant  2001 Central 1 16.66666667 Cormorant 
Wooded Is Tufted Puffin   2001 Central 87 0.890116636 Auk 

何かアドバイスが高く評価され、ありがとうございました!

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希望の出力が何であるか分かりません。たぶんサンプルテーブルですか? – pyll

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@pyll私の望ましい出力は、セクション内または家族内の種の「包括的な」相関となります。私はパーセントと年の種サブセット(すなわち、タフテッド・パフィン)との相関関係を行っただけですが、これは場所を考慮していないので、サンプリングエリア全体にわたってその種についてコルコフ、p値などがありますが、私はそれが統計的に正しいとは思わない。 – LearningTheMacros

答えて

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これはスタックオーバーフローの問題の範囲外であり、おそらくより統計的に指向したフォーラムに投稿する必要があります。

しかし、私はveganパッケージをチェックアウトし、特にCanonical Correspondence分析またはPrincipalコンポーネント分析を調べます。あなたが次元性を減らし、多くの異なるグループ化変数間の有意な/有用な相関関係を見ることを可能にするような順序付け方法。

Vegan

モデルにおける変数の一つとして、時系列で更新

、時間を通じて繰り返さコレクションに関連する影響があるかどうかを判断するために、統計学的に正しいだろう。多方向のANOVAは、順序付け方法において点群を見つけるよりも、変数間の相関を決定する上でより有用であり得る。

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私は同意しますが、他の統計情報フォーラムと比較してスタックオーバーフローにはるかに多くのトラフィックがあります。私はNMDS分析の前にビーガンで働いていました。しかし、これがこれに当てはまるかどうかは分かりませんが、もう一度チェックします。 – LearningTheMacros

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NMDSはかなり限定されたIMOですが、重要なグループ化変数を理解するために別の方法を使用することもできます。別の方法として、すべてのグループ化変数について、準ポアソン分布を持つカウントデータから一般線形を作成し、p値から有意性を決定するためにf検定を使用することができます。 –

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私はGLMを試しましたが、私はそれが私が探しているものだとは思わない。私はまた、PCAかCCAが私が探しているものであるかどうか確信しています。基本的に私は大規模な地理的エリア内の人口の異なる個体群で個体数が時間の経過とともに変化しているかどうかを確認しようとしていますが、私が行った600個の相関を行うことを除いてどのように行うのかはわかりません。私は、各種の人口の何パーセントが減少/増加しているのかを統計的に示すことができますか? もっと包括的な方法がありますか? – LearningTheMacros