ggplot2を使ったプロットのデータがありません

Question

ggplot2とちょっと混乱します。私は自分のデータをプロットし、そのプロットにいくつかの欠けているデータを持っていますが、伝説ではありません。私は実際に40のグループ（FID）がプロットされ、いくつかは欠落しています。

Data48a <- read.table("Data48a.eigenvec", header = T, sep = "") 

PlotData48a <- ggplot(Data48a, aes(x= PC1,y= PC2, group= FID, shape= FID, color= FID)) 

PlotData48a + geom_point(aes(color=FID)) + 
    geom_hline(aes(yintercept=0)) + geom_vline(aes(xintercept=0))+ 
    scale_shape_manual(values=1:nlevels(Data48a$FID)) + 
    scale_color_manual(values=1:nlevels(Data48a$FID)) + 
    coord_equal(ratio = 1) 

、ここでエラーです：私のコードがある

In grid.Call.graphics(L_points, x$x, x$y, x$pch, x$size) : unimplemented pch value '28'  

私のデータは以下のようである：これはあなたの全体の問題を解決する場合

FID IID PC1 PC2 PC3  
Ami AX-AM-013607-1-01 0.0302889 -0.0236855 0.0294569  
Ami AX-AM-013608-1-01 0.0346382 -0.0232841 0.0175366  
Ami AX-AM-013609-1-01 0.0396438 -0.0157996 0.0163948  
Ami AX-AM-013610-1-01 0.0386903 -0.017313 0.0146025  
Ami AX-AM-013611-1-01 0.0382764 -0.0151733 0.0222798  
Ami AX-AM-013613-1-01 0.0416853 -0.00826403 0.0245685  
Ami AX-AM-013614-1-01 0.0388888 -0.0113679 0.0281065  
Ami AX-AM-013615-1-01 0.0438035 -0.0102871 0.0156296  
Ami AX-AM-013616-1-01 0.0364263 -0.0211585 0.0246802  
BatakKaro ID-KR-000001-1-01 0.0321929 0.00520535 0.00480784  
BatakKaro ID-KR-000002-1-01 0.0345291 -0.00101008 -0.00264379  
BatakKaro ID-KR-000012-1-01 0.0352078 -0.000998926 -0.00847158  
BatakKaro ID-KR-000014-1-01 0.0306035 -0.00150602 -0.00365927 

Answer 1

私は知らないが、これは、エラーの原因を強調する必要があります。

40レベルのデータまたはグループをプロットしようとしていますが、プロット文字は25個しかありません（pch）。エラーを取り除くためには、グループ数を25以下に制限しなければならないと思います。

require(ggplot2) 

# no error 
xx = 1:25 
ggplot() + geom_point(aes(x = xx,y = xx), col=xx,shape=xx) 

# error 
xx = 1:26 
ggplot() + geom_point(aes(x = xx,y = xx), col=xx,shape=xx) 

Answer 2

実装されていないPCH値 '28'：

法的形状値番号0〜25、および番号は32

あなたが40台の形状を有しているようだ127へ（0..39 ）？

も参照してください