2017-01-24 8 views
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オブジェクトA、B、C、Dが正の値であると仮定します。一方、オブジェクトE、F、G、Hは、負の値としてスコア付けされた負である。私は真の正と負を計算したい&最後にFDRを計算するために、偽陽性陰性です。 Rの各オブジェクトのFDRを計算するには? DataRの真陽性、陰性および偽陽性陰性を用いたFDR計算?

答えて

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R FDRの計算では、p.adjust関数を使用してp値として入力するのが最適です。 p値の範囲が0から1であるとすれば、あなたの記述はあなたのソース統計がp値ではないと信じさせます。どのような分布オブジェクトA、B、C、D、E、F、G、Hがオンになっているか知っていますか?あなたは1つか2つの尾のテストを望むかどうか知っていますか?

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参照セットを使用してベイジアン分析を行い、正と負のオブジェクトは参照セットです。オブジェクトは遺伝子であると考えられ、スコアはベイズファクター(BF)であるため、FDRを計算するためのp値は存在しません。私は詳細を先に説明したはずです。私の統計知識の欠如、私は "False discovery rate is(FP/FP + TP)、 の精度は1-FDRで、recall = TP /(TP + FN)からの計算に従っていました。ここで のポジティブとネガティブは参照セット "を参照してください。 – Kwangi

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