numz配列をsavezで保存するときにnumpy配列に注釈を付けることができます

Question

私のプログラムはnumpyのsavezルーチンで保存する大きなデータ配列を作成するとします。しかし、私はまた、その配列と一緒にいくつかの追加情報を保存したいと思います。例としては、現在のバージョンのgit commit IDと、データを生成するために使用された入力パラメータを使用して、後でデータを見て、作成した方法を正確に知ることができます。

この情報をnpzファイルに直接配列とともに保存する方法はありますか、別のファイルを作成する必要はありますか？

Answer 1

次のことができるようにする必要があります

In [2]: a = np.arange(10) 

In [3]: b = 'git push' 

In [5]: np.savez('file',a=a,b=b) 

In [7]: data = np.load('file.npz') 

In [8]: data.keys() 
Out[8]: ['a', 'b'] 

In [9]: data['a'] 
Out[9]: array([0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9]) 

In [10]: str(data['b']) 
Out[10]: 'git push' 

だから、あなたは、任意の名前のデータを保存して、辞書のようなオブジェクトを取得することができます。おそらくそれは、より柔軟性があり、メタデータのすべての種類のためのサポートが組み込まれています使用するより良いフォーマットがh5pyまたはpytablesのいずれかを使用してHDF5です：一言で言えば

http://h5py.alfven.org/docs/

http://www.pytables.org/

Answer 2

、あなたは（できます.npzはちょうど節約されたディクテーションです）、おそらく他のものに切り替える方が良いでしょう。 （ちょうど@JoshAdelが.npzに固執したい場合にこれを行う良い例を投稿したようです。）

HDFはこのようなもののはるかに良い選択です。

hdfファイルの各グループまたはデータセットには、属性を格納できます。

numpy配列をhdfファイルに格納する場合は、h5pyをお勧めします。

例として：

import numpy as np 
import h5py 

somearray = np.random.random(100) 

f = h5py.File('test.hdf', 'w') 

dataset = f.create_dataset('my_data', data=somearray) 

# Store attributes about your dataset using dictionary-like access 
dataset.attrs['git id'] = 'yay this is a string' 

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