DICOMをTIFFに変換する

Question

私はPythonを初めて使っていますので、私の無知を許してください。私は、ディレクトリを介してラスターを試して、TIFFファイル内のすべてのDICOMファイルを変換しています。私は検索機能を働かせましたが、TIFFとして画像を保存するのに苦労しています。私は、PICICOMライブラリを使ってDICOMを読み込み、ヘッダー情報を操作しています。また、私は、TIFFに保存するためにpydicomのsave_as関数を使用しようとしましたが、TIFFの圧縮を適切に設定するために、PILのsave関数を使用します。問題は、DICOMから実際のイメージデータを抽出し、新しいイメージに配置する方法を理解できない/理解できないことだと思います。何か助けていただければ幸いです。 PIL 1.1.7 Pydicom 0.9.6

Answer 1

あなたは.tiffなどの画像データを保存するためにPILを使用する方法を知っている場合は、this exampleはpydicomからPILに画像データを渡すためにあなたを助けるべきである（here in the comments以上があります）。

import pylab 
import dicom 
ImageFile=dicom.read_file(<SourceFilePath>) #Path to "*.dcm" file 
pylab.imshow(ImageFile.pixel_array,cmap=pylab.cm.bone) #to view image 

か場合：私は、サイトを覚えていないが、しかし、私は自分のコードに適用されるだけでなく、他人のためにここでそれを共有し、いつか戻って同じクエリにオンライン答えを見つけ

Answer 2

使用代わりに、その後、画像を保存する：デフォルトで pylab.imsave('<DestinationFilePath>',ImageFile.pixel_array,cmap=pylab.cm.bone)

imsave意志がはしかし .png形式で画像を保存します。 imsave()がサポートされている場合は、希望する形式を指定することができます。

希望します。