ggplot2の円パッキングで階層データを視覚化するには？

Question

私はサークルパッキングプロットから「トップダウン」ビューでツリーをプロットしたい

> library(dplyr) 
> df <- data_frame(id = 1:6, parent_id = c(NA, 1, 1, 2, 2, 5)) 
> df 
Source: local data frame [6 x 2] 

    id parent_id 
    (int)  (dbl) 
1  1  NA 
2  2   1 
3  3   1 
4  4   2 
5  5   2 
6  6   5 

、例えば、いくつかの階層データを持っている：上記 http://bl.ocks.org/mbostock/4063530

リンクはd3ライブラリ用です。 ggplot2でそのようなプロットを作ることができる同等物はありますか？

（このプロットはd3をサポートしていますが、以前はd3を使用していませんでしたが、学習曲線がわからない場合はd3を選択してくださいおかげで）

Answer 1

2つのステップがありました。（1）データを集約し、（2）jsonに変換します。その後、すべてのjavascriptがそのサンプルページに書き込まれているので、結果のjsonデータをプラグインできます。

集計されたデータは、ツリーマップと同様の構造を持つ必要があるため、treemapパッケージを使用して集約を行います（連続した集計でループを使用することもできます）。次に、d3treeR（githubから）を使用してツリーマップデータを入れ子リストに変換し、jsonliteを使用してリストをjsonに変換します。

パッケージにあるGNI2010のサンプルデータを使用しています。すべてのソースファイルはplunkerにあります。私ものindex.htmlを起動して、光沢のあるバインディングを作成するには

が表示されるはずその後

<script src="https://cdnjs.cloudflare.com/ajax/libs/d3/3.5.5/d3.min.js"></script> 

に例index.htmlでソース行を置き換え

library(treemap) 
library(d3treeR) # devtools::install_github("timelyportfolio/d3treeR") 
library(data.tree) 
library(jsonlite) 

## Get treemap data using package treemap 
## Using example data GNI2010 from d3treeR package 
data(GNI2010) 

## aggregate by these: continent, iso3, 
## size by population, and color by GNI 
indexList <- c('continent', 'iso3') 
treedat <- treemap(GNI2010, index=indexList, vSize='population', vColor='GNI', 
       type="value", fun.aggregate = "sum", 
       palette = 'RdYlBu') 
treedat <- treedat$tm # pull out the data 

## Use d3treeR to convert to nested list structure 
## Call the root node 'flare' so we can just plug it into the example 
res <- d3treeR:::convert_treemap(treedat, rootname="flare") 

## Convert to JSON using jsonlite::toJSON 
json <- toJSON(res, auto_unbox = TRUE) 

## Save the json to a directory with the example index.html 
writeLines(json, "d3circle/flare.json") 

はなんとかする必要がありますhtmlwidgetsといくつかの例を使用してください（d3treeRのソースにはいくつかあります）。色付けのように、特定のことが機能していないことに注意してください。ここに格納されているjsonには、実際にノードで使用される多くの情報（treemapを使用して集計されたすべてのデータ）が含まれています。