IPython（ノート）シェルコマンドにインライン入力を提供するにはどうすればよいですか？

Question

いくつかのシェルコマンドとその入力を含むIPythonノートブックをまとめたいと思います。

bash-3.2$ mysql -u root <<END_IPUT 
> use mydb; 
> show tables; 
> END_INPUT 

私はIPythonで同じ効果を得るにはどうすればよい

、特にjupyterノートで：bashプロンプトで、私は「ヒアドキュメント」構文を使用することができますか？私はいくつかの構文上の細かな点を有効にする方法を示し、「ライン魔法」または「セル 魔法」、例えば：

In [7]: !! ls -tF 
Out[7]: ['Demo-notebook.ipynb', 
      'createdb.sql', 
      ... 

私はIPython as a system shellで見てきた、とIPythonとしてシェルコマンドを実行する方法を知っています。以下の後、私は!または

# Turn everything in $PATH into an alias; 
# then enable calling aliases without ! or % 
%rehashx  
%autocall 2 

!!を付加することなく、システムコマンドを実行することができます。しかしこれのどれも、これらのコマンドをインラインに入力を提供するのに役立ちますしない：パイソンSyntaxErrorにヒアドキュメント構文はIPythonでは無効であり、その結果。それで私はどうしますか？

Answer 1

bashセルのマジックでは、複数行のbashを入力できます。ただ、%%bashで任意のセルを開始します。

%%bash 
echo "This is bash" 
ls 

あなたが別のプログラムにパイプテキストにヒアドキュメントを使用している場合、あなたはまた、スクリプトセル魔法使用することができます。

%%script bc 
2+3 

を、他の細胞があるかもしれませんより具体的にあなたの問題に対処する魔法！

Answer 2

さらに詳しい研究と、@ ThomasKのヒント（受け入れられた回答を参照）の助けを借りて、これを行う方法がいくつか見つかりました。

• 一つの解決策は、%sx魔法の細胞です。セルの内容をbashスクリプトとして実行し、出力をキャプチャして行のリストとして返します。ときには便利な、時にはない。

  In[1]: %%sx 
       echo Hello, world 
       cat -n <<DATA 
       this 
       and that 
       DATA 
  
  Out[1]: ['Hello, world', '  1\tthis', '  2\tand that'] 
  

• %%bashへの変更、@ThomasKが提案され、出力がプリントアウトされ、返さないと。それ以上の処理のためにキャプチャするために、ipythonは--outパラメータを提供します。しかし、私はそれを自分で印刷する必要があります。デフォルトでは表示されません。

  In[1]: %%bash --out var 
       echo Hello, world 
       echo " Again" 
  
  In[2]: var 
  
  Out[2]: 'Hello, world\n Again\n' 
  

• %%bash実際%%script bashの略記である、（%%script?のヘルプを参照してください）「スクリプトで#!ラインのように」作業として請求。それは何か。ここでは、このドキュメントの構文を省略して、どのプログラムでもセルの内容を入力として読み取らせる方法があります。 %%scriptは、--outパラメータも受け入れます。

   %%script --out var mysql -u root -p XYZ 
       USE somedb; 
       SELECT * FROM users 
        WHERE passwd IS NULL\G 
  

これは十分にいいですが、私のユースケースがmysqlあるので、私はそれを使用していないことになった、そして最終的に私は、私が代わりに使用することができます偉大なサードパーティipython-sql拡張子があることを発見：

%load_ext sql 
%sql mysql+pymysql://user:passwd@localhost/somedb 

これは、拡張子のインストールには、pip install ipython-sqlを前提としています。 mysqlについては、pip install pymysqlも必要でした。上記設定後、私は実際にちょっといいですボーダーとノートブックテーブルとしてを描かれている。この

In[1]: %%sql 
     SELECT * FROM users 
      WHERE passwd IS NULL 

Out[1]: 1 rows affected. 
     ... 

返されるテーブルのようなデータベースに話します。そしてそれは私が_からつかむことができるパンダのデータフレーム（スマートリスト）として利用可能になりました。