colnameをcolnameの部分文字列に置き換えます。

Question

私のデータフレームのcolnamesを元のcolnameの一意の文字列に置き換えることができますか？

> colnames(df.iso) 
[1] "../trimmed/100G.tally.fasta" "../trimmed/100R.tally.fasta" "../trimmed/106G.tally.fasta" 
[4] "../trimmed/106R.tally.fasta" "../trimmed/122G.tally.fasta" "../trimmed/122R.tally.fasta" 
[7] "../trimmed/124G.tally.fasta" "../trimmed/124R.tally.fasta" "../trimmed/126G.tally.fasta" 
[10] "../trimmed/126R.tally.fasta" "../trimmed/134G.tally.fasta" "../trimmed/134R.tally.fasta" 

Answer 1

私たちは、列名から部分文字列を抽出するために?basenameでsubを使用することができます。変更を反映するために出力を列名に戻します。

colnames(df.iso) <- sub("\\..*", '', basename(colnames(df.iso))) 

我々はbasenameを使用したくない場合は、subも単独で使用することができます。 @ Akrunの二番目の答えに同様

colnames(df.iso) <- sub("([^/]+/){2}([^.]+).*", 
           "\\2", colnames(df.iso)) 

Answer 2

、

colnames(df.iso) <- sub("[^0-9]+([0-9]+[A-Z])\\.tal.*", "\\1", colnames(df.iso)) 

もトリックを行う必要があります。彼の最初の方法はおそらく早いですが、おそらくここでは関係ありません。