`knitcitations`パッケージを使って.csl、.bibファイルを添付する方法はありますか？

Question

私はmyPkg_vignette.Rmdにknitcitationsパッケージを使用してbibliography.bib, nature.cslファイルを添付しようとしましたが、私は.Rmdファイルを実行すると、私は次のエラーました：

pandoc-citeproc.exe: Could not find bibliography.bib 
pandoc.exe: Error running filter pandoc-citeproc 
Filter returned error status 1 
Error: pandoc document conversion failed with error 

を私はknitcitationsマニュアルに見て、どのように便利で.csl, .bibファイルを添付しかし、私は警告を受け、これらのファイルをmyPkg_vignette.Rmdに添付することはできません。

編集：

これはbibliography.bibの文脈である：

@article{Vahid_Jalili_Musera_2015, 
     title = "MuSERA: Multiple Sample Enriched Region Assessment", 
     author = {Vahid Jalili, Matteo Matteucci, Marco Masseroli, Marco J. Morelli}, 
     journal = "Briefings in Bioinformatics", 
     year = "2016", 
     pages = "1-15", 
      url  = {http://bib.oxfordjournals.org/content/early/2016/03/23/bib.bbw029.abstract?keytype=ref&ijkey=8IlROGziM9XA7NS}, 
     doi  = "10.1093/bib/bbw029 ", 
} 

どのように私は簡単にパッケージのビネットにbibliography.bib、nature.cslを添付することができますか？私はSOでいくつかの記事を読み、私は与えられた解決策について混乱させた。私はknitcitationsパッケージを使用することで全く新しいです、そして、私は正しい方法で.bib, .csl filesをつけて間違っているかもしれません。 Rstudioでこの問題に対処する方法を教えてもらえますか？何か案が ？どうもありがとう:)

NEW EDIT：私はthis postを読み、ソリューションを追ってきた

：

setwd('C:/Users/me/Documents/myPkg') 
Sys.setenv(TEXINPUTS=getwd(), 
      BIBINPUTS=getwd(), 
      BSTINPUTS=getwd()) 

が、.Rmdファイルにbibliography.bib印刷されません。 Rnwファイルをknitrに織り込むためのグローバルオプションを変更しました。 .Rmdファイルに参考文献を印刷するにはどうしたらいいですか？さらに助けてください？

Answer 1

Dirkと同様に、それは私のために働くだけです。たぶんあなたはYAMLを適切に一緒に置かなかったかもしれません。あるいは何かを引用したことがないかもしれません。ここにあなたのよだれかけファイルで動作するサンプル文書です：

--- 
title: "Biblio Example" 
output: html_document 
bibliography: bibliography.bib 
--- 

```{r setup, include=FALSE} 
knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE) 
``` 

## Here's Some Text 

This text cites the paper: [@Vahid_Jalili_Musera_2015]. 

## References 

The bibliography will appear by magic at the end of the document, just 
below this text. 

は詳細についてはhttp://rmarkdown.rstudio.com/authoring_bibliographies_and_citations.htmlを参照してください。

Answer 2

問題は私の.bibファイルが.Rbuildignoreにリストされていたことでした。エントリを削除すると問題が解決しました。

Duncan Murdochのr-pkg-devメーリングリストの回答によると、.Rbuildignoreは、 "トップレベルのパッケージソースディレクトリに対するファイル名とディレクトリ名とはまったく関係ありません"です。

したがって、xxx.bibというエントリは、すべて.bibというファイルをパッケージディレクトリに再帰的に無視し、エラーがスローされました。