bashを入力してファイルを選択する

Question

bashをに入力すると、ユーザに入力を促してから、selectで使用するファイルを要求します。しかし、ディレクトリに3つありますが、マークされているのは1つだけなので、ファイルの1つしか選択できません。しかし、入力前にselectファイルを置くと、bashが動作するようです。私はそれを修正するように見えない、何が間違っている？ありがとう。

端末

1) 12_newheader_base_counts.txt 
    34_newheader_base_counts.txt 
    56_newheader_base_counts.txt 

に表示バッシュ

# enter gene input 
printf "%s \n" "Please enter gene(s), use a comma between multiple:" 
OLDIFS=$IFS 
IFS="," 
read -a genes 
for ((i = 0; i < ${#genes[@]}; i++)) 
do 
printf "%s\n" "${genes[$i]}" >> /home/cmccabe/Desktop/NGS/panels/GENE.bed 
done 

# select file 
printf "please select a file to analyze with entered gene or genes \n" 
select file in $(cd /home/cmccabe/Desktop/NGS/API/test/bedtools;ls);do break;done 
     echo $file "will be used to filter reads, identify target bases and genes less than 20 and 30 reads, create a low coverage bed for vizulization, and calculate 20x and 30x coverage for the entered gene(s)" 
logfile=/home/cmccabe/Desktop/NGS/API/test/process.log 
for file in /home/cmccabe/Desktop/NGS/API/test/bedtools/$file; do 
echo "Start selcted file creation: Panel: ${FUNCNAME[0]} Date: $(date) - File: $file" 
bname=$(basename $file) 
pref=${bname%%.txt} 
echo "End selected file creation: $(date) - File: $file" 
done >> "$logfile" 

所望の末端表示

1) 12_newheader_base_counts.txt 
2) 34_newheader_base_counts.txt 
3) 56_newheader_base_counts.txt 

Answer 1

既にIFSの変更により、はあなたのディレクトリリストを考慮する方法を破ります：IFS=,で、,で区切られた項目を探していますが、lsの出力は改行で区切られています。

IFSをselectより前の以前の値（IFS=$OLDIFS）に復元する必要があります。

また、私は上場サブシェルの出力の代わりにglobingシェルを使用することをお勧めします：

select file in /home/cmccabe/Desktop/NGS/API/test/bedtools/*; 

Answer 2

あなたはOLDIFSにIFS値を保存したが、その後、あなたがそれを回復しなかったように思えます。 selectコマンドで使用する拡張では、IFSをデフォルト値に戻す必要があります。