私はPythonの初心者だと私はこの問題に遭遇してきたと私はそれに取り組んで行くだろうかわからないのpython

Question

を使用して、特定の位置に文字が出現する回数を数えます。

私は次のシーケンス/文字列を使用している場合：

GATCCG

GTACGC

私は、各文字が各位置で発生する頻度を数える方法へ。すなわち）Gは、二つの配列で二度1位で発生し、A等の位置1でゼロ回発生

すべてのヘルプはあなたに感謝、感謝されるだろう！

Answer 1

あなたはとても似defaultdictとenumerateの組み合わせを使用することができます。

from collections import defaultdict 

sequences = ['GATCCG', 'GTACGC'] 
d = defaultdict(lambda: defaultdict(int)) # d[char][position] = count 
for seq in sequences: 
    for i, char in enumerate(seq): # enum('abc'): [(0,'a'),(1,'b'),(2,'c')] 
     d[char][i] += 1 

d['C'][3] # 2 
d['C'][4] # 1 
d['C'][5] # 1 

これは、第1および第2のキーとしての位置として文字をとり、文字はで言ったの発生回数を提供し、ネストされたdefaultdictを構築しますその位置。

max_len = max(map(len, sequences)) 
d = defaultdict(lambda: [0]*max_len) # d[char] = [pos0, pos12, ...] 
for seq in sequences: 
    for i, char in enumerate(seq): 
     d[char][i] += 1 

d['G'] # [2, 0, 0, 0, 1, 1] 

Answer 2

ない、これが最良の方法ですが、あなたはそれぞれの文字のタプルを生成する、文字列の転置の並べ替えを行うにはジップを使用できることを確認：あなたは、位置カウントのリストが必要な場合

位置、例えば：あなたは、Tから

[('G', 'G'), ('A', 'T'), ('T', 'A'), ('C', 'C'), ('C', 'G'), ('G', 'C')] 

見ることができます：

x = 'GATCCG' 
y = 'GTACGC' 

zipped = zip(x,y) 

print zipped 

が出力として生成されます彼はその後、あなたが望むもので取得するためにカウンタ（またはいくつかの他の方法）を使用することができますなど、二つの文字列の最初の位置は、2つのGを含んで、第二の位置はAとTが含まれていることをタプル。