matplotlibまたはgraphvizを使用してnetworkxでマルチグラフを描画する方法

マルチグラフnumpy隣接行列をnetworkxに渡したとき（from_numpy_matrix関数を使用） matplotlibを使用してグラフを描画しようとすると、複数のエッジが無視されます。matplotlibまたはgraphvizを使用してnetworkxでマルチグラフを描画する方法

どのようにして複数の辺を描画することもできますか？

出典

2013-02-18 Rick Sanchez

http://stackoverflow.com/questions/10379448/plotting-directed-graphs-in-python-in-を使用してwrite_dotを呼び出すことですa-way-that-show-all-edges-separateとhttp://stackoverflow.com/questions/15053686/networkx-overlapping-edges-when-visualizing-multigraph –

これはnetworkxに実装されていないこともあります。 – famargar

Graphvizは平行エッジを描画するのに適しています。ドットファイルを作成してGraphvizで処理することで、NetworkXでそれを使うことができます（例えば、以下のneatoレイアウト）。あなたがNetworkX 1.11以降でNetworkX

In [1]: import networkx as nx 

In [2]: G=nx.MultiGraph() 

In [3]: G.add_edge(1,2) 

In [4]: G.add_edge(1,2) 

In [5]: nx.write_dot(G,'multi.dot') 

In [6]: !neato -T png multi.dot > multi.png

enter image description here

に加えて、PYDOTまたはpygraphvizが必要になります、nx.write_dotはissue on networkx githubどおりに動作しません。この問題を回避するには、

from networkx.drawing.nx_pydot import write_dot

または

from networkx.drawing.nx_agraph import write_dot

matplotlibまたはgraphvizを使用してnetworkxでマルチグラフを描画する方法

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